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HIGHLIGHTS

Doctoral training

Thesis students at the LIPM belong to the Toulouse doctoral school SEVAB (Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques et Bioingénieries). In addition to a thesis supervisor, each student also benefits from the assistance of a thesis committee which meets every year in the presence of the supervisor. Students also follow a number of additional training courses and must possess a basic knowledge of English. The doctoral school organizes yearly meetings for students to present their research projects, and the LIPM encourages students to attend at least one international congress during the course of their thesis.

SEVAB covers 23 research laboratories, and is divided into 6 research themes. The LIPM belongs to theme 5: Plant-Microbe Interactions. Thesis projects are proposed by the respective laboratories and open for competition organized by the doctoral school (for more information see the SEVAB web-site; thesis projects). Research groups can also accept thesis students from the “Ecoles Normales Supérieures”.

Masters and Ingénieur training

The LIPM welcomes a significant number of students each year (2-6 months training) from a variety of schools and universities, and in particular Masters students following the Microbiology-AgroBiosciences (MABS) courses at the Toulouse Paul Sabatier University. Other students come from the Institut National des Sciences Appliquées (INSA) or the Ecole Nationale Supérieure d'Agronomie (ENSAT).

NEW ! 

Ingénieur-e de recherche en calcul scientifique

Le projet EcoControl, financé par le PEPR AgroEcologie & Numérique, vise à décrire, comprendre, prédire les régulations naturelles d’insectes ravageurs de cultures par des insectes parasitoïdes afin d’envisager une alternative à l’utilisation de pesticides. 

Dans ce projet, la mission de notre équipe est de concevoir une architecture informatique pour : 

- Analyser massivement des séquences et des images pour accélérer l’assignation taxonomique des insectes parasitoïdes encore insuffisamment caractérisés. 

- Intégrer l’ensemble des données et des connaissances issues de la littérature, les connaissances des experts du domaine membres du projet, et les prédictions des modèles développés par nos partenaires. 

- Proposer une interface d’interrogation des données et des connaissances du projet utilisable en langage naturel aussi bien par des experts que par des agriculteurs. 

Votre mission sera de : 

- Structurer et renseigner le Data Lake qui consolidera les données et les connaissances du projet.

- Développer ou intégrer les pipelines d’analyses pour l’assignation taxonomique à partir de séquences et d’images.

- Développer une première version fonctionnelle d’un agent conversationnel, exploitant un RAG (Retrieval Augmented Generation), pour exploiter le plus précisément et simplement possible les données et les connaissances stockées dans le Data Lake.

  • Contrat : Mission temporaire

  • Durée : 16 mois

  • Début du contrat : 01/07/2025

  • Formation : Master/Ingénieur (Bac+5), Spécialisation : Informatique, calcul scientifique, bioinformatique

  • Rémunération : entre 2 815.82 € et 3 189.96 € mensuel brut selon expérience

  • Date limite : 11/05/2025

> Plus d'infos

> Contact :  Jérôme Gouzy 

NEW ! 

Assistant ingénieur : Gestionnaire financier et comptable (F/H) par voie de concours interne

Vous exercerez votre activité au sein du Service administratif et financier  du LIPME. Ce service de six personnes est coordonné par la responsable administratif et financier. L'activité du service est organisée en 5 pôles : missions, commandes, gestion du budget, gestion des contrats de recherche, gestion du personnel. Le service est en relation directe avec les tutelles INRAE et CNRS et les services d'appui à la recherche (SDAR du centre Occitanie-Toulouse, départements SPE et BAP pour INRAE et Délégation Régionale Occitanie-Ouest pour le CNRS).


Votre mission : gérer les contrats de recherche de l'unité dans le respect des techniques, des règles et des procédures applicables au domaine de la gestion financière et/ou comptable. Vous serez référent-e du pôle «Contrats de recherche» en binôme avec la responsable administratif et financier mais vous pourrez intervenir ponctuellement en continuité de service sur tous les autres pôles du SAF. 
Le SAF intervient sur la gestion de chaque contrat de recherche depuis le montage du projet sur les aspects financiers, à la ventilation des crédits jusqu'aux justifications, de concert avec le scientifique porteur et en lien avec la tutelle gestionnaire.
Vous serez amené-e à :
-Conseiller, accompagner les porteurs de projet dans le montage financier de leur projet en rapport avec le règlement financier des appels à projet.
-Effectuer la ventilation des crédits et le suivi de l'exécution des dépenses.
-Elaborer les justifications financières intermédiaires et finales en lien avec les scientifiques.
-Assurer le suivi régulier de l'implication des agents sur les feuilles de temps.
-Réajuster les ventilations des projets et échanger avec les financeurs si besoin.
-Assurer les échanges et répondre aux sollicitations des services partenariat et finances contrats (SFC) des tutelles.
-Classer et archiver les pièces de dépenses et les justificatifs.
-Mettre en oeuvre les procédures applicables dans le domaine de la gestion financière des contrats.
-Alimenter les bases de données et les tableaux de bord.
-Assurer une veille sur les appels à projets et sur leurs règlements.
-Assurer des activités occasionnelles en continuité de service (missions, commandes, livraisons, envois, courrier).

  • Formation en comptabilité et gestion financière.

  • Profil:  AI25-SPE-4

  • Guide du candidat

  • Calendrier de la campagne :

- Ouverture des inscriptions : 15 avril 2025

- Clôture des inscriptions : 20 mai 2025
- Épreuves d’admissibilité : du 8 au 19 septembre 2025  (études des dossiers)
- Épreuves d’admission : du 13 au 24 octobre 2025 (auditions)
- Nominations des lauréats : à compter du 1er décembre 2025

> Plus d'infos

> Contact :  Laurent Noël et Sandrine Barrère

NEW ! 

Chaire de professeur Junior : Génétique et génomique de l’attractivité du tournesol pour les pollinisateurs

Nature et objet du projet de recherche à développer et activités associées
Dans les écosystèmes agricoles, le tournesol est une ressource nutritive majeure pour les pollinisateurs, notamment pour les abeilles mellifères et participe à réduire leurs pathogènes. Cependant l'attractivité des variétés et leur capacité mellifère est très variable et les bases génétiques de celle-ci sont quasi-inconnues. Il est donc important de développer au-delà de la productivité, qui reste un enjeu majeur, du profil de résistance aux bio-agresseurs et de la tolérance aux stress abiotiques, un concept de phénotype étendu pour le tournesol qui inclut l'attractivité et la valeur nutritive des nectars et pollen pour les pollinisateurs et de produire les connaissances génétiques, physiologiques et phénomiques nécessaires à l'amélioration de ce phénotype étendu. Pour cela, vous exploiterez et développerez les ressources présentent au CRB Tournesol-Soja pour étudier le contrôle génétique de l’attractivité pour les pollinisateurs. Une grande diversité génétique permettant des approches de GWAS est présente dans la core-collection publique de tournesol (Mandel et al., 2011). Celle-ci comprend des variations de teneur en sucres, du nectar, de couleurs de ligules ou de profondeurs de corolle. Ce panel est en cours d’augmentation grâce au projet PEPR AgroDiv et sera mobilisé pour étudier la composition métabolomique du nectar, la profondeur des fleurons, la couleur des ligules et les taux de visite des hyménoptères, diptères et lépidoptères, principaux pollinisateurs du tournesol. De plus, au-delà de l’attractivité, la qualité nutritive du pollen/nectar revêt une importance capitale. La teneur en protéines est un facteur déterminant dans la qualité des colonies d’abeilles. Aussi la variabilité des teneurs en protéines sera analysée sur les ressources génétiques. Une forte variation entre les espèces est connue, mais la variabilité génétique intra-spécifique n’a encore pas été évaluée.
Par une approche de génétique et génomique fonctionnelle, la personne recrutée développera le matériel génétique pour valider les polymorphismes causaux pour ces composantes de l’attractivité et de la nutrition. Sur les aspects méthodologiques, vous participerez au développement de méthodes de phénotypage des caractères d'attractivité, comme la durée de floraison, la production de pollen, la reconnaissance des pollinisateurs et de leurs comportements à partir d’images et de vidéos en lien avec la plateforme de Phenotoul et en collaboration avec les spécialistes des abeilles présents à Toulouse  et au niveau national. Enfin, dans le prolongement de ces travaux, vous participerez à la mise en place de critères pour le développement d'un phénotype étendu de tournesol incluant le service aux pollinisateurs dans le cadre du CTPS.

Nature et objet du projet d’enseignement
Le projet d’enseignement est construit en partenariat avec Toulouse INP-ENSAT. Ces enseignements contribueront à mieux intégrer le LIPME dans le tissu d’enseignement supérieur toulousain. Vous interviendrez à plusieurs niveaux dans le cursus des étudiants ingénieurs agronomes pour une charge de 64h/an. En tronc commun, l’agent pourra participer à l’Unité d’Enseignement « Ressources Génétiques et Biodiversité » ou à l’UE « Sciences Agronomique dans un contexte de Transition ». Au second semestre de 2e année, vous pourrez participer à la mise en place d’une UE thématique spécifique autour de la génétique et des interactions génotype-phénotype-environnement ou participer aux enseignements des UE thématiques « Plante dans son environnement » ou « Biodiversité et Agriculture ». Au niveau de la 3e année, vous renforcerez l’équipe enseignante autour de la génétique et l’amélioration des plantes dans le cadre de la spécialisation « Agrobiosciences Végétales ». Le service d’enseignement pourra être complété par des interventions ponctuelles dans les Masters Biologie Végétale (parcours Biologie des Plantes et Microorganismes Associés) et Functional Biology and Ecology (parcours TULIP GS).

  • Formation : Doctorat en génétique et génomique quantitative et des populations, connaissances de base de la biologie végétale. 

  • Contrat : 3 ans, puis, à l’issue de cette période et après évaluation de votre valeur scientifique et de votre aptitude professionnelle, vous pouvez accéder à un emploi de titulaire dans le corps des directeurs et directrices de recherche de 2e classe (DR2).

  • Clôture des inscriptions : 28 mai 2025

> Plus d'infos

> Contact :  Laurent Noël et Nicolas Langlade

Concours de chargés de recherche de classe normale sur profil (H/F) : Chargé-e de recherche en immunité végétale sous environnement fluctuant​​​​​​​​​​​​
 

  • Mission :  Vous explorerez en laboratoire les effets des fluctuations de paramètres abiotiques de l'environnement sur la réponse immunitaire des plantes au niveau phénotypique et moléculaire

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​Vous rejoindrez l'équipe QIP « Immunité quantitative des plantes » (www.qiplab.weebly.com) qui étudie le dialogue moléculaire entre les champignons pathogènes et leurs plantes hôtes. 
Les changements climatiques actuels se caractérisent par des conditions météorologiques plus instables. Les variations répétées de l'environnement sont responsables de phénomènes de priming, d'insensibilisation et d'interférence qui modifient la capacité des plantes à se défendre vis-à-vis des agents pathogènes, augmentant l'incidence de maladies. A ce jour, peu de fluctuations de l'environnement ont été étudiées pour leur effet sur l'immunité des plantes, et les bases moléculaires sous-jacentes sont largement inconnues.
Vous explorerez en laboratoire les effets des fluctuations de paramètres abiotiques de l'environnement sur la réponse immunitaire des plantes au niveau phénotypique et moléculaire. Vous construirez un projet afin d'identifier les bases génétiques de la mémoire somatique des plantes par laquelle les conditions environnementales affectent durablement la physiologie cellulaire et les réponses immunitaires associées. Vous étudierez la nature, la régulation, la diversité et le mode d'action des gènes impliqués afin de comprendre comment les plantes s'adaptent aux fluctuations environnementales. L'équipe QIP dispose de résultats préliminaires obtenus dans le cadre du métaprogramme INRAE SumCrop concernant l'effet des fluctuations journalières de température et de vent sur la réponse immunitaire de la plante modèle Arabidopsis. Cette recherche sera conduite avec le champignon pathogène Sclerotinia sclerotiorum capable d'infecter de nombreuses plantes dicotylédones, permettant d'étendre vos travaux à des modèles d'intérêt agronomique. 
Vous exploiterez vos compétences de génétique et pathologie végétale, de biologie moléculaire et d'analyse de données omiques. 

  • Calendrier de la campagne 2025
    - Ouverture des inscriptions : 28 janvier 2025
    - Clôture des inscriptions : 4 mars 2025
    - Épreuve d'admissibilité : avril 2025
    - Épreuve d'admission : du 2 au 18 juin- Prise de fonction : à partir du 1er septembre 2025

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