Régulation épigénétique des symbioses plantes-microbes : Nous étudions le rôle des modifications et régulateurs épigénétiques dans la mise en place des symbioses entre plantes et microorganismes. En particulier, nous explorons les mécanismes moléculaires par lesquels les longs ARNs non-codants et les éléments transposables participent au remodelage de la transcription et de la structure de la chromatine au cours du développement du nodule, organe symbiotique fixateur d’azote produit de la symbiose entre légumineuses et bactéries de type rhizobia. Pour cela, nous combinons des approches de biologie moléculaire, de génétique, de transcriptomique, d’épigénomique, et de microscopie.

Matthias Benoit a obtenu son Doctorat en Physiologie et Génétique Moléculaire dans le laboratoire Genetics, Reproduction and Development (GReD, Clermont-Ferrand, France), supervisé par Dr. Aline V. Probst. Ses travaux ont démontré l’importance des variants d’histones dans l’organisation de la chromatine aux cours des transitions développementales chez les plantes, notamment durant le développement précoce de la plante modèle Arabidopsis thaliana. Il a ensuite rejoint The Sainsbury Laboratory Cambridge University (SLCU, Cambridge, UK) et l’équipe de Jurek Paszkowski pour étudier les mécanismes épigénétiques et environnementaux impliqués dans le contrôle des éléments transposables chez les plantes cultivées. Matthias a complété sa formation en rejoignant l’équipe de Zach Lippman (Cold Spring Harbor Laboratory, New York, USA) pour mener des travaux sur l’importance de la variation épigénétique et structurale au cours de la domestication et de l’histoire évolutive de la tomate.