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Tel +33(0)61 28 53 24

Mots clés

biologie moléculaire, génétique reverse, microscopie et imagerie cellulaire, Medicago, rhizobia, facteurs de transcription, communication et signalisation cellulaire

Fernanda de Carvalho-Niebel

Directeur de recherche DR2  CNRS

Équipe ENOD

SUJETS DE RECHERCHE

Interactions plantes-microorganismes, symbioses racinaires.

FORMATION

FORMATION

2008 :              HDR, Université Toulouse 3, Paul Sabatier.

1994 :              Doctorat en biotechnologie végétale à l’Université de Gand (Belgique).

PARCOURS PROFESSIONEL 

Statut Actuel

Directeur de recherche 2ème classe DR2-CNRS au LIPME, Toulouse.

Chef d’équipe au LIPME, Toulouse.

Avant :

2002 :                Promotion au grade de Chargé de recherche CR1 CNRS, au LIPME, Toulouse. 

1998 :                Recrutée comme chercheur CNRS-CR2 au LIPME, Toulouse.

1995-1998 :     Post-doctorante au LIPME (financements : EMBO, EC, INRAE)

FINANCEMENTS RECENTS

Live-Switch PRCI-ANR (2020-2023); CREPE-SPE-INRAE (2020-2022); FRAIB-AO-INTERUNITE-CROSS (2019-2022).

COLLABORATIONS

A. Becker (SYNMIKRO, Marburg, Germany); E. Larrainzar (University of Navarra, Pamplona, Spain); M. Marín (LMU, Munich, Germany); Peter Kaló (NAIK, Gödöllő, Hungary) ; F. Cartieaux, V. Hocher & S. Svistoonoff (LSTM, Montpellier); P. Frendo & E. Boncompagni (ISA, Sophia-Antipolis); R. Peyraud (iMEAN, Toulouse); N. Frei-Dit-Frey, P-M. Delaux & E. Jamet (LRSV, Toulouse).

ENSEIGNEMENT

-Master International LABEX-TULIP (cours à venir), Master ADAM-Toulouse (tutorats), cours doctorants (La Plata Argentine, 2017).

-Encadrement de Post-docs/Doctorants et Masters. 

MEMBRE COMITE

-Membre nommée du Conseil Scientifique du département SPE-INRAE.

-Membre des comités d’animation des réseaux nationaux INRAE SYMBIPHYT (depuis 2021) et SYMBIFIX (2018-2020).

-Membre nommée du Conseil Scientifique du LABEX−TULIP et co-responsable scientifique du projet phare du LABEX−TULIP « Reconnaissance et Signalisation Reprogrammation symbiotique »

- Membre du comité de recrutement des chercheurs CRCN de l'INRAE-BAP concours BAP-CRCN (2020).

- Membre des jurys de recrutement de professeurs ou Maitre de Conférences (Nice, Montpellier, Toulouse).

- Evaluateur externe pour postes de professeur et « group leader » (UK, Danemark).

ACTIVITE EDITORIALE

-Révision de manuscrits (Nature Plants, Nature Comm, Plant Cell, New Phytol…) et projets (DFG, NSF…).

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

 
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Tel  +33(0)61 28 53 27

Mots clés

Symbiotic nodule development, transcription factors, non-coding RNAs, transcriptional and epigenetic regulation of nodulation

Andreas Niebel

Directeur de Recherche DR2 CNRS

Équipe ENOD

SUJETS DE RECHERCHE

Nous travaillons sur le contrôle génétique et épigénétique du développement des nodosités symbiotiques chez Medicago truncatula.

FORMATION

Andreas a obtenu son doctorat à l'Université de Gand en 1994 dans le laboratoire de Marc van Montagu, en étudiant les cellules nourricières géantes induites dans les racines des plantes par des nématodes endoparasites. En tant que post-doctorant de l'EMBO, il a ensuite travaillé sur l'interaction symbiotique légumineuse-Rhizobium, au LIPM où il a ensuite été recruté comme chercheur par le CNRS.

FINANCEMENTS RECENTS

ANR PIOSYM (2020-2024); CNRS-LIA (International associated laboratory) France-Argentina NOCOSYM (2018-2021). MYCONODISLAND (FRAIB; 2021-2022).

COLLABORATIONS

International: F. Ariel (Instituto de Agrobiotecnología del Litoral (IAL), Santa Fe, Argentina); F. Blanco & E. Zanetti (Instituto de biotechnologia y biologia molecular (IBBM), La Plata, Argentina); E. Larrainzar (Public University of Navarra (UPNA), Spain; K. Szczyglowski (University of Western Ontario, Canada); Senjuti Sinharoy (National Institute of Plant Genome Research, New Delhi, India). National: M. Benhamed, M. Crespi, F. Frugier (IPS2, Paris-Saclay);

ENSEIGNEMENT

3-6H/an en Master

ACTIVITE EDITORIALE

Je révise des manuscrits pour Plant Cell, Plant physiology, Plos Genetics, Nature plants, Trends in Plant Sciences et New Phytologist.

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

LIENS

Twitter: @andreas_niebel

HOBBY

Vélo, course à pied, natation, triathlon, randonnée en montagne

 
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Tel +33(0)61 28 50 51

Mots clés

Symbiose Légumineuse-Rhizobium, Medicago truncatula, Sinorhizobium meliloti, microscopie électronique

Marie-Christine Auriac

Ingénieur d'étude IE CNRS

Équipe ENOD

SUJETS DE RECHERCHE

Interactions biotiques de plantes avec des symbiotes et des pathogènes, abordées par des approches de cytologie et microscopie

FORMATION

Doctorat de biologie et physiologie végétales - Formation en microscopie photonique et électronique

COLLABORATIONS

- Mireille Chabaud (LIPME, Equipe SPI), sur l'interaction Tournesol/Orobanche

- Jean-Marc Routaboul (LIPME, Equipe SIX), sur la visualisation des hydathodes de Brassicaceae.

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

 
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Tel  +33(0)61 28 53 27

Mots clés

NF-YA1, transcription facteur pionnier, Modificateur de chromatine, Proximity labeling

Thi Thu Dang

Post-Doctorante

Équipe ENOD

SUJETS DE RECHERCHE

Je travaille sur le facteur de transcription pionnier NF-YA1 dans les nodules symbiotiques

FORMATION

Thi Thu Dang a obtenu son doctorat dans le laboratoire Plant Molecular Genetics, Nara Institute of Science and Technology (NAIST, Japan), 2009-2013. Son projet de thèse consistait à caractériser la Constitutively Active OsRac1 (CA-OsRac1), un régulateur clé de l'immunité chez le riz, généré par recombinaison homologue.  De 2015 à 2017, Thu a fait son premier post-doc dans le laboratoire Plant Immunity Signaling, Shanghai Center for Plant Stress Biology, China. Elle y a continué son travail par une étude du régulateur OsGAPC3, en aval de OsRAC1, qui joue un rôle important dans la voie du NO et la modification d'histones. De 2017 à 2020, elle a rejoint l'équipe Conserto à l'INRAE d'Angers pour son second postdoc. Son projet portait sur l'identification du réseau de protéines qui régule ABI4, un facteur de transcription contrôlant le contenu en chlorophylle des graines et la longévité. Depuis Octobre 2020, Thu a rejoint l'équipe ENOD pour travailler sur le projet ANR 'PIOSYM' qui a pour but l'évaluation de l'importance de NF-YA1 comme facteur de transcription pionnier régulant la formation de nodules symbiotiques chez Medicago.

FINANCEMENTS RECENTS

ANR PIOSYM (2020-2023)

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

  • Thu Thi Dang, Zenpei Shimatani, Yoji Kawano, Rie Terada, Ko Shimamoto. Gene editing a constitutively active OsRac1 by homologous recombination-based gene targeting induces immune responses in rice. Plant and Cell Physiology, Volume 54, Issue 12, December 2013, Pages 2058–2070

  • Julia Zinsmeister, Souha Berriri, Denise Puntel Basso, Benoit Ly-Vu, , David Lalanne, Edvaldo Aparecido Amaral da Silva, Olivier Leprince, Julia Buitink. The seed-specific heat shock factor A9 regulates the depth of dormancy in Medicago truncatula seeds via ABA signaling. Plant Cell Environ. 2020;1–15.

  • , Masayuki Fujiwara, Satoshi Hamada, Megumi Wakabayashi, Ai Yao, Qiong Wang,Ken-ichi Kosami, Thu Thi Dang, Takako Kaneko-Kawano, Ko Shimamoto, Yoji Kawano. The Small GTPase OsRac1 forms two distinct immune receptor complexes containing the PRR OsCERK1 and the NLR Pit. July 2020. Plant and Cell Physiology.DOI: 10.1101/2020.07.01.183301

LIENS

HOBBY

Photographie, Calligraphie

 
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Joëlle Fournier

CRHC CNRS

Équipe ENOD

SUJETS DE RECHERCHE

Mécanismes cellulaires de la colonisation rhizobienne des légumineuses

FORMATION

Tel  +33(0)61 28 53 24

Doctorat de l'Université de Toulouse en Physiologie Végétale (1989)

Mots clés

Symbiose Rhizobium-Légumineuses, cordons d'infection, microscopie confocale in vivo, Medicago truncatula, Sinorhizobium meliloti, endosymbioses, biologie cellulaire

FINANCEMENTS RECENTS

Live-Switch PRCI-ANR (2020-2023); CREPE-SPE-INRAE (2020-2022)

COLLABORATIONS

A. Becker (SYNMIKRO, Marburg, Germany); M. Marín (LMU, Munich, Germany); F. Cartieaux, V. Hocher & S. Svistoonoff (LSTM, Montpellier); R. Peyraud (iMEAN, Toulouse).

ENSEIGNEMENT

Contribution au Master 2 ADAM (Adaptation, Développement et Amélioration des plantes en présence de Microorganismes) de l'Université Toulouse III

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

 
 
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Tel  +33(0)61 28 53 24

Mots clés

Symbiose Légumineuse-Rhizobium, biologie moléculaire, clonage, culture des plantes, transformation des plantes

Lisa Frances

TCS INRAE

Équipe ENOD

SUJETS DE RECHERCHE

Symbiose Légumineuse-Rhizobium. Je participe aux activités de recherche de l’équipe dans le thème « régulation et dynamique de l'infection rhizobienne »

FORMATION

DUT génie biologique ( Agronomie) en 1999, puis Diplôme universitaire de Responsable en Biotechnologie végétale (2000), Université de Perpignan

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

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Tel +33(0)61 28 50 51

Mots clés

endosymbioses, legumes, root nodule development, genomics, epigenetics, regulation of gene expression

Pascal Gamas

Directeur de recherche DR1 CNRS

Équipe ENOD

SUJETS DE RECHERCHE

Transcriptional and epigenetic regulations during root nodule symbiosis; late stages of nodule development; symbiotic transcription factors; sequence and functional organization of Medicago truncatula genome;  long non-coding RNAs; Cytokinin signaling during nodulation; M. truncatula expression and knowledge databases

FORMATION

PhD in Microbiology (University of Toulouse, France; Michael Chandler's lab; bacterial transposons); postdoc at UCSF (San Francisco, USA; Nancy Craig's lab; bacterial transposons)

FINANCEMENTS RECENTS

ANR EPISYM (2016-2020); INRA-SPE (EFFOR, 2019-2020)

COLLABORATIONS

Jérôme Gouzy and Sébastien Carrère (LIPME), Martin Crespi, Florian Frugier and Moussa Benhamed (IPS2, Paris-Saclay), Jeremy Murray (John Innes Centre, Norwich, UK / Institute of Plant Physiology & Ecology, CAS, Shanghai, China)

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

LIENS

 
 
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Ambre Guillory

Post-doctorante

Équipe ENOD

SUJETS DE RECHERCHE

Je participe aux axes de recherche de la thématique « Régulation et dynamique de l'infection rhizobienne », principalement dans l’étude des stades précoces de l’infection des poils racinaires par microscopie confocale in vivo. Dans le cadre du projet collaboratif Live-Switch, nous étudions notamment la reprogrammation cellulaire du symbionte Sinorhizobium meliloti au cours de ces étapes précoces, en particulier afin de la corréler avec la reprogrammation des cellules végétales en cours d’infection.

Tel  +33(0)561 28 53 24

Mots clés

Endosymbioses, Biologie Cellulaire, Interaction modèle Medicago truncatula/Sinorhizobium meliloti, Microscopie Confocale in vivo, Processus d’infection

FORMATION

Licence en biologie cellulaire et physiologie (Paris VII, 2015),

Master en sciences du végétal (Paris VII, 2017),

Doctorat en biologie végétale (Paris Saclay, 2020)

COLLABORATIONS

Macarena Marín, LMU, Institute of Genetics, Munich

Anke Becker, UMR, SYNMIKRO and Faculty of Biology, Marburg

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

https://orcid.org/0000-0002-5836-4582

- Guillory A, Bonhomme S. Methods for Medium-Scale Study of Biological Effects of Strigolactone-Like Molecules on the Moss Physcomitrium (Physcomitrella) patens. Methods Mol Biol. 2021;2309:143-155. doi: 10.1007/978-1-0716-1429-7_12. PMID: 34028685.  

- Lopez-Obando M, Guillory A et al. The Physcomitrium (Physcomitrella) patens PpKAI2L receptors for strigolactones and related compounds highlight MAX2 dependent and independent pathways, bioRxiv 2020.11.24.395954; doi: https://doi.org/10.1101/2020.11.24.395954

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Tel  +33(0)561 28 50 51

Mots clés

Symbiose RhizobiumMedicago truncatula, organogénèse nodulaire, transcriptomique, biostatistiques

Marie-Françoise Jardinaud

MCF ENSAT-INPT

Équipe ENOD

SUJETS DE RECHERCHE

Étude transcriptionnelle de la différentiation des nodosités lors de l’interaction Medicago truncatula - Rhizobium

FORMATION

Doctorat en biologie cellulaire, laboratoire Biotechnologie et Amélioration des plantes, ENSAT-INPT, Toulouse, France

ENSEIGNEMENT

Biostatistiques (ENSAT-INP), Physiologie végétale – classification - Evolution ( La Prépa des INP, INPT)

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

 
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Tel +33(0)61 28 53 27

Mots clés

Développement des nodules symbiotiques, facteurs de transcription, non-coding RNAs, régulation transcriptionnelle et épigénétique de la odulation, microscopie, techniques de cytologie, Technovit

Agnès Lepage

TCE CNRS

Équipe ENOD

SUJETS DE RECHERCHE

Je participe au travail sur le contrôle génétique et épigénétique du développement des nodosités symbiotiques chez Medicago truncatula, dans les cadre des projets dirigés par Andreas Niebel (PIOSYM, NOCOSYM, MYCONODISLAND)

FORMATION

Formation

PRODUCTION SCIENTIFIQUE