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ISCG

International Consortium on Sunflower Genomics

 

Le consortium international en génomique du tournesol (ICSG, International Consortium on Sunflower Genomics) coordonné par LIPME-INRAE Occitanie-Toulouse, réunissant la France, le Canada, les Etats-Unis et l’Israël, ainsi que 8 partenaires privés, est lancé pour une durée de 4 ans. L’ICSG a pour objectif de caractériser la diversité génétique du tournesol en séquençant de nouveaux génomes de tournesol sauvages. Ces ressources permettront de comprendre la structure des génomes et leur évolution ce qui facilitera l’utilisation des ressources génétiques de tournesols sauvages pour la sélection variétale.

 

THEMES DE RECHERCHE

L’ICSG réunit les principaux acteurs internationaux de la communauté académique d’une part et les entreprises de biotechnologie et de semences d'autre part.

Il va permettre de :

  • séquencer et comparer les génomes de nouveaux génotypes de tournesol et d’espèces sauvages.

  • développer et caractériser les ressources génétiques

  • produire un atlas des gènes impliqués dans la réponse au stress

  • rendre les ressources génomiques disponibles grâce au développement et au soutien d'outils bioinformatiques.

Il sera alors possible de comparer les génomes et ainsi mettre en évidence les différences (notamment structurales) pour améliorer la résistance des variétés cultivées aux bioagresseurs ou aux stress abiotiques.

Liens externes:

Twitter: @ICSG_Sunflower

www.heliagene.org

https://www.sunflowergenomics.com/

PARTENAIRES

 
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PUBLICATIONS

Todesco M, Owens GL, Bercovich N,  Légaré JS,  Soudi S, Burge DO, Huang K, Ostevik KL, Drummond EBM, Imerovski I, Lande K,  Pascual MA, Cheung W, Staton SE, Muños S, Nielsen R, Donovan LA, Burke JM, Yeaman S, Rieseberg LH. (2020) Massive haplotypes underlie ecotypic differentiation in sunflowers. Nature 584:602-607.

Hübner S., Bercovich N., Todesco M., Mandel J.R., Odenheimer J., Ziegler E., Lee J.S., Baute G.J., Owens G.L., Grassa C.J., Ebert D.P., Ostevik K.L., Moyers B.T., Yakimowski S., Masalia R.R., Gao L., Ćalić I., Bowers J.E., Kane N.C., Swanevelder D.Z.H., Kubach T., Muños S., Langlade N.B., Burke J.M., Rieseberg L.H. (2019) Sunflower pan-genome analysis shows that hybridization altered gene content and disease resistance. Nature Plants 1: 54-62.

Badouin H., Gouzy J., Grassa C.J., … Muños S., Vincourt P., Rieseberg L.H. and Langlade N. (2017) The sunflower genome provides insights into oil metabolism, flowering and Asterid evolution. Nature, 546: 148-152.