Tel
Sclerotinia
RAFFAELE Sylvain
DR1
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Sujets de recherche
FORMATION
Financements récents
FINANCEMENTS RECENTS
Financements récents
COLLABORATIONS
Collaborations
ENSEIGNEMENT
Enseignements
MEMBRE COMITE
Membre comité
ACTIVITE EDITORIALE
Activités éditoriales
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Productions scientifiques
Tel: +33 (0)561285327
Mots clés
Champignon phytopathogène, agent pathogène oomycète, effecteur de pathogénie, gènes de résistance, résistance quantitative, plante cultivée
GODIARD Laurence
CRHC
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Mécanismes immunitaires des plantes et facteurs de virulence des agents pathogènes
Depuis 2019 : Résistance des plantes au champignon pathogène à large spectre Sclerotinia sclerotiorum : de nouvelles pistes issues des facteurs de virulence du champignon
FORMATION
1985 : Ecole Normale Supérieure Section sciences naturelles (Paris)
1988 : Master Recherches en Microbiologie de l’Institut Pasteur (Université Paris VII-Jussieu)
1992 : Doctorat de Biologie Moléculaire (Université Paul Sabatier de Toulouse)
2012 : Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) (Université Paul Sabatier de Toulouse)
FINANCEMENTS RECENTS
Projet Plant2Pro ImmuSoy : Renforcer l’immunité du soja contre le champignon pathogène Sclerotinia sclerotiorum.
COLLABORATIONS
Entreprises semencières RAGT 2n, LIDEA
Yann Pecrix (CIRAD), Guillaume Besnard (CNRS, EDB), François Delmotte (INRAE)
MEMBRE COMITE
Membre élu du Bureau de la Société Française de Phytopathologie, SFP.
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
BARBACCI Adelin
CRCN
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Sujets de recherche
FORMATION
Financements récents
FINANCEMENTS RECENTS
Mots clés
Financements récents
COLLABORATIONS
Collaborations
ENSEIGNEMENT
Enseignements
MEMBRE COMITE
Membre comité
ACTIVITE EDITORIALE
Activités éditoriales
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Productions scientifiques
ORMANCEY Mélanie
CR
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Lors de mon doctorat, je me suis intéressée au rôle des protéines 14-3-3 et d’une protéine kinase dépendante du calcium dans la mort cellulaire induite par une mycotoxine. J’ai ensuite réalisé un premier post-doctorat au cours duquel j’ai étudié le rôle des peptides lors de stress d’origine biotique ou abiotique. Puis, j’ai effectué un deuxième post-doctorat afin d’acquérir des connaissances et des compétences en épigénétique. Je me suis intéressée au transcriptome et à l’épigénome d’Arabidopsis thaliana en réponse au froid, dans des conditions mimant ce que les plantes peuvent rencontrer dans leur environnement naturel.
J’ai été recrutée en 2026 en tant que CRCN INRAE. Mes travaux de recherche visent à étudier les mécanismes moléculaires par lesquels l’acclimatation environnementale et la mémoire influencent la réponse immunitaire chez la plante modèle A. thaliana. Pour cela, je combine à la fois des approches de biologie moléculaire, de génétique, d’épigénomique et de transcriptomique.
FORMATION
Depuis 2026 : Chargée de Recherche (CRCN INRAE), LIPME, Auzeville-Tolosane, France
2022 - 2025 : Post-doctorat dans l’équipe de Dr. Julia Qüesta (Epigénétique et développement des plantes), CRAG, Barcelone, Espagne
2016 - 2021 : Post-doctorat dans l’équipe de Dr. Jean-Philippe Combier et Dr. Serge Plaza, LRSV (Peptides et petits ARNs), Auzeville-Tolosane, France
2013 - 2016 : Doctorat dans l’équipe de Dr. Christian Mazars (Signalisation calcique), LRSV, Auzeville-Tolosane, France
FINANCEMENTS RECENTS
Bourse post-doctorale MSCA-PF-2022 (2023 - 2025) - COOLCASE - Uncovering the regulatory landscape of Arabidopsis thaliana responses to cold temperatures
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Adresse
Tel
Mots clés
KHAFIF Mehdi
IE
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Sujets de recherche
FORMATION
Financements récents
FINANCEMENTS RECENTS
Financements récents
COLLABORATIONS
Collaborations
ENSEIGNEMENT
Enseignements
MEMBRE COMITE
Membre comité
ACTIVITE EDITORIALE
Activités éditoriales
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Productions scientifiques
ZAFFUTO Matilda
AI
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Après avoir passé environ deux ans en tant qu’assistante ingénieur contractuelle au LIPME, j’ai été recrutée dans l’équipe QIP en Septembre 2023. J’interviens sur différents projets de l’équipe, afin de participer à la mise en place du séquençage ARN en single cell et de prendre part aux techniques de biologie moléculaire, principalement.
FORMATION
2017 : Licence en Biologie Cellulaire et Physiologie (BCP) - Université Paul Sabatier, Toulouse
2018 : Licence Professionnelle Génome et Biotechnologie pour l'Amélioration des Plantes (GeBAP) - Université Paul Sabatier, Toulouse
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Productions scientifiques
SUIN Amandine
CDD AI
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Projet ImmuSoy : Renforcer l’immunité du soja contre le champignon Sclerotinia sclerotiorum.
FORMATION
BTSA ANABIOTEC en apprentissage (équipe GenEpi-GenPhySE)
Licence Professionnelle BAE option pharmacogénomique et diagnostic moléculaire (équipe GenEpi-GenPhySE)
COPPEL Adèle
Etudiante en thèse
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Effets du vent sur le système immunitaire des pantes (Glycine Max et Arabidospis thaliana) par une approche biomécanique.
FORMATION
Licence de Physique Chimie
Master en Physique et Mécanique du Vivant (physique fondamentale) à l’Université Paul Sabatier TOULOUSE
BOURDON Chloé
CDD IE
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Trafalgar : Identifier le rôle de la traduction des protéines dans la régulation de la virulence chez Sclerotinia sclerotiorum.
FORMATION
2022 - Master en Biologie des plantes et des Microorganismes (BPMA), Toulouse
2021 - Licence Biologie des plantes pour l’agroenvironnement (BIPA), Montpellier
2019 - DUT Génie Biologique, Caen
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Tel: 05 61 28 57 79
Mots clés
Interaction plante pathogène environnement
Sclerotinia sclerotirum
Arabidopsis thaliana
MACQUET Joris
Etudiant en thèse
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Actuellement en thèse, j’étudie les mécanismes moléculaires se situant à l’interface entre la résistance quantitative à Sclerotinia sclerotiorum et la perception des signaux abiotiques de l’environnement.
FORMATION
2019 - Licence de biologie Cellulaire et physiologie - Université Paul Sabatier (Toulouse)
2021 - Master Biologie Végétale - Université Paul Sabatier (Toulouse)
FINANCEMENTS RECENTS
Projet jeune scientifique IGOWaN (Immunity GOne With the wiNd) financé par Fédération de Recherche Agrobiosciences, Interactions et Biodiversité.
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Joris Macquet*, Shantala Mounichetty*, Sylvain Raffaele : Genetic co-option into plant–filamentous pathogen interactions. Trends in plant science Published: July 28, 2022 DOI: https://doi.org/10.1016/j.tplants.2022.06.011
DELPLACE Florent
Post-Doc
QIP
SUJETS DE RECHERCHE
Florent DELPLACE a obtenu son master en Biologie Végétale à l'Université Toulouse en 2017. Il a ensuite effectué au LIPME sa thèse intitulée « La résistance quantitative à Xanthomonas campestris pv. campestris : la kinase atypique RKS1 contrôle un réseau immunitaire décentralisé et régule le microbiote foliaire » supervisée par Dominique Roby et Fabrice Roux. Entre 2020 et 2021, il a réalisé 201.9h eq. TD d’enseignement en Physiologie Végétale et Biochimie en tant qu’ATER à l’université Paul Sabatier.
Depuis 2022, Il travaille en tant que Chercheur Postdoctoral sur les mécanismes moléculaires sous-jacents à la Résistance Quantitative des Plantes (QDR) contre le champignon nécrotrophe Sclerotinia sclerotiorum. Son objectif principal de recherche est de retracer les origines évolutives des réponses de défense contre Sclerotinia au sein de l'espèce Arabidopsis, et dans un deuxième objectif, de décoder l'hétérogénéité cellulaire des réponses immunitaires contre Sclerotinia.
FORMATION
2021 – Doctorat Interaction plantes-microorganismes - Université Toulouse III
« La résistance quantitative à Xanthomonas campestris pv. campestris : la kinase atypique RKS1 contrôle un réseau immunitaire décentralisé et régule le microbiote foliaire » encadré par Dominique ROBY et Fabrice ROUX
2017 - Master Biologie Végétale, Parcours ADAM - Université Toulouse III
2015 - Licence Biologie, Parcours MABS - Université Toulouse III
FINANCEMENTS RECENTS
APPEL A PROJET 2023 JEUNES SCIENTIFIQUES – FRAIB : Unraveling ancestral characteristics of quantitative resistance at the cellular level (UniveRCell) – 5000€
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Delplace F.*, Huard-Chauveau C.*, Dubiella U., Khafif M., Alvarez E., Langin G., Roux F., Peyraud R. and Roby D. (2020) Robustness of plant quantitative disease resistance is provided by a decentralized immune network. Proc. Natl. Acad. Sci., 117(30):18099-18109. *These authors contributed equally to this work.
Delplace F., Huard-Chauveau C, Berthomé R., and Roby D. (2021) Network organization of the plant immune system: from pathogen perception to robust defense induction. Review for The Plant Journal, (2):447-470.
Delplace F., Huard-Chauveau C,, Roux F., and Roby D. (2024) The Arabidopsis leucine rich repeat receptor-like kinase MIK2 interacts with RKS1 and participates to the control of quantitative disease resistance to the bacterial pathogen Xanthomonas campestris. bioRxiv. 10.1101/2024.01.29.577741.
Delplace F., Khafif M. and Raffaele S. (2024) Diverse transcriptome reprogramming trajectories underlie quantitative disease resistance at the species level. bioRxiv. 10.1101/2024.02.15.580486.