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Tel
Mots clés
Clare GOUGH
Directrice de recherche CNRS
Co-responsable du groupe SMS
clare.gough@inrae.fr
SUJETS DE RECHERCHE
En 1985, lorsque j’ai commencé ma thèse dans l’équipe de Mike Daniels au John Innes Institute (UK), je me suis intéressée aux interactions plantes-bactéries. J’ai d’abord participé à l’étude génétique et moléculaire des déterminants pathogènes des bactéries phytopathogènes Xanthomonas campestris et Ralstonia solanacearum, et de leurs plantes hôtes. J’ai ainsi contribué, dans l’équipe de Christian Boucher au LIPM, à la découverte que les gènes hrp codent pour un système de sécrétion de type III conservé avec les bactéries pathogènes des mammifères. En 1998 j’ai été recrutée par le CNRS dans l’équipe de Jean Dénarié au LIPM. Depuis, j’étudie les mécanismes moléculaires et génétiques de la perception et de la signalisation des signaux symbiotiques rhizobiens et mycorhiziens chez Medicago truncatula. J’ai participé à l’identification et la caractérisation d’une voie de signalisation facteur Nod chez M. truncatula, et à la démonstration que cette voie est commune aux deux symbioses. Je suis particulièrement intéressé dans les protéines de type récepteur à domaine LysM dans les interactions plantes-microorganismes, et les interconnections entre les mécanismes de signalisation biotic et abiotic, incluant le rôle de la signalisation rédox.
FORMATION
-
Habilitation à Diriger les Recherches (2004); Paul Sabatier University, Toulouse, France
​
-
PhD (1989); John Innes Institute, East Anglia University, UK
​
-
Bachelor of Science in Botany (Hons) (1985); Cambridge University, UK
FINANCEMENTS RECENTS
ANR Project "DUALITY" (Receptor proteins and redox control at the interface of symbiosis & immunity) coordinated by C. Gough, 2021-2024.
​
ANR Project "GRASP" Analysis of the genetic basis of symbiotic partner choice for improving symbioticnitrogen fixation in pea) coordinated by V. Bourion 2016-2022.
​
ANR Project "AOI" (Autoregulation of infection in the rhizobium-legume symbiosis) coordinated by J. Batut, 2015-2021.
COLLABORATIONS
A. Boscari, Institut Sophia Agrobiotech (ISA), UMR INRA- Université Côte d’Azur-CNRS, Nice
C. Jacquet, Laboratory of Research in Plant Science (LRSV), UMR CNRS-UPS, Toulouse
J.F. Arrighi, Laboratory of Tropical and Mediterranea n Symbioses (LSTM) UMR IRD-CIRAD-INRAUM/Agro-M, Montpellier
V. Bourion, UMR Agroécologie, INRAE, Dijon
Tel
Mots clés
Sandra BENSMIHEN
Directrice de recherche (CNRS)
Co-responsable du groupe SMS
sandra.bensmihen@inrae.fr
SUJETS DE RECHERCHE
Je suis généticienne et biologiste du développement de formation. Après une thèse sur le développement de la graine chez Arabidopsis (Gif_sur-Yvette), un 1er post doc sur le développement et la morphogenèse des feuilles (JIC, Norwich), puis un 2nd post doc sur la signalisation symbiotique lors de la nodulation chez Medicago truncatula (LIPM), j’ai été recrutée au CNRS pour animer un axe de recherche sur l’effet des signaux symbiotiques microbiens sur le développement des racines. Pour cela, j’utilise des approches de transcriptomique, génétique inverse et génétique quantitative. Mes domaines d’intérêt comportent :
-
Le phénotypage racinaire (moyen et haut débit)
-
Les cross-talks des voies de signalisation des signaux symbiotiques et des voies hormonales
-
Le développement racinaire chez Medicago truncatula
-
Les cross-talks entre tissus de la racine (épiderme et cortex)
FORMATION
-
Novembre 2014 : Habilitation à diriger de recherches, Université Paul Sabatier, Toulouse
-
2006-2008 : Stage post-doctoral dans l’équipe de C. Gough (LIPM) sur l’analyse structure-fonction de NFP dans la spécificité d’hôte
-
2003-2006 : Stage post-doctoral dans l’équipe de E. Coen (JIC, Norwich) sur la modélisation du développement des feuilles chez Anthirrhinum majus et Arabidopsis thaliana
-
2003-2000 : thèse de doctorat Université Orsay Paris Sud, à l’ISV de Gif sur Yvette, directeur F. Parcy, équipe de J. Giraudat.
FINANCEMENTS
Passés :
AAP INRA-SPE 2016 : LCAUX, coordinatrice S . Bensmihen (2017-2018)
FRAIB : AUXIMED, coordinatrice S . Bensmihen, collab C. Jacquet (LRSV Toulouse) pour mettre en place le phénotypage racinaire à TPMP (2018),
Projet « interlabex » OPERA « optimisation du phénotypage moyen débit pour Medicago truncatula », coordinatrice, collab. P. Nacry, BPMP, Montpellier. (2019)
Actuels :
FRAIB: SINGULARITY , coordinatrice S. Bensmihen, collab. JM Couzigou (LRSV, Toulouse) (2020-2022) pour développer des approches de séquençage “noyaux uniques”
Participante des projets ANR DUALITY (2021-2024, coord. Clare Gough) et SYMWAY (2022-2026, coord. JF Arrighi, Montpellier)
COLLABORATIONS
- Académiques internationaux :
H. Motte et T. Beeckman, VIB Ghent, Belgique, dans le cadre du projet LCAUX, 2017-2018, (coord. S. BENSMIHEN).
D. O’Connor, Cambridge University, Angleterre. Pour les travaux sur Brachypodium (Buendia et al., 2019a).
N. Provart, Bio-Analytic Resource for Plant Biology (BAR), Toronto, Canada. (Herrbach et al., 2017).
M. Libault, University of Nebraska, Lincoln, USA : collaboration sur la technologie « single cell », à poursuivre dans le cadre du projet SINGULARITY (2020-2022, coord S. BENSMIHEN) et de l’initiative « Thomas Jefferson Fund ».
- Académiques français :
P. Nacry, BPMP, Montpellier, pour le phénotypage racinaire (dans le cadre du projet OPERA, 2019, coord. S. BENSMIHEN)
N. Peeters, TPMP, LIPME, Toulouse et groupement « Phénome » : pour le phénotypage racinaire haut débit (projet AUXIMED, 2018, coord S. BENSMIHEN).
M. Bonhomme/ C. Jacquet, LRSV, Toulouse : pour la GWAS et dans le cadre du projet ANR NICECROPS (Bonhomme, Bensmihen et al., 2021)
JM Couzigou, LRSV, Toulouse : pour la production de matériel pour le projet de transcriptomique « single cell » (projet SINGULARITY 2020-2022, coord. S. BENSMIHEN) et l’initiative « Thomas Jefferson Fund » (2021-2023).
C. Maugis, INSA, Toulouse : statisticienne, analyse de données transcriptomiques sur les cinétiques et single cell. Projet LCAUX et projet SINGULARITY (coord. S. BENSMIHEN). Projet « MITI » DDisc (2021-2024, coord. P. Neuvial).
Plateforme métabolomique MetaboHub, Toulouse : pour les dosages d’hormones et de métabolites secondaires (Buendia et al., 2019a)
PARTICIPATION A DES COMITES/INSTANCES SCIENTIFIQUES
2016- 2020 : Membre élue au conseil scientifique de la FR-AIB ;
2016-2020 : Membre élue au conseil scientifique de l’école doctorale SEVAB
2021-2025 : responsable de l’axe « Développement des plantes, interactions biotiques et abiotiques » (23 équipes d’accueil sur 3 unités différentes) de l’ED SEVAB
Co-animatrice du comité de suivi des étudiants en thèse du LIPME
Octobre 2019-actuel : membre élue du conseil exécutif de l’EUR (Ecole Universitaire de Recherche) TULIP-GS
Février 2021-actuel : membre du comité d’animation scientifique du réseau Symbiphyt (INRAE-SPE, Coordination M. Lepetit et A. Carlier).
Janvier 2019-Janvier 2023 : co-organisatrice du workshop « Légumineuses » (Legumes) à la conférence internationale Plant and Animal Genome (PAG), San Diego, USA.
ENSEIGNEMENT
2000-2003 : monitorat (chargé d’enseignement contractuel) à l’université Orsay-Paris Sud (64h/ an)
2008-2018 : Vacations de TP et TD en physiologie végétale en Licence (L1/L2) à l’UPS, Toulouse
2010-actuel : participation aux ateliers bibliographiques pour les étudiants de M2R.
2021 : cours pour le M2R Paris-Saclay
ACTIVITES DE VULGARISATION SCIENTIFIQUE
Présentation orale aux Jeudis Sciences de la FR-AIB (séminaire de vulgarisation scientifique pour le pôle INRAE d’Auzeville) : « Les plantes aussi ont des hormones » (Septembre 2017)
Participation à ESOF (European Science Open Forum), Muséum d’Histoire Naturelle, Toulouse, Juillet 2018
Activité de vulgarisation sur les légumineuses dans les écoles primaires (octobre 2021) et les lycées (2010, 2011)
Depuis janvier 2020 : co-organisatrice des séminaires Jeudi Sciences de la FR-AIB
Nicolas PAULY
Maître de conférences (UCA)
SMS
nicolas.pauly@inrae.fr
SUJETS DE RECHERCHE
Sujets de recherche
Adresse
FORMATION
-
Habilitation à Diriger les Recherches (2013), Université Nice Sophia Antipolis.
-
Doctorat de Biologie (2002), Université Paul Sabatier (UPS), Toulouse, France.
Tel
Mots clés
FINANCEMENTS RECENTS
Financements récents
COLLABORATIONS
Collaborations
ENSEIGNEMENT
Mes enseignements sont dispensés à l’Université Côte d’Azur (anciennement Université Nice Sophia Antipolis ; du L1 au M2), à l’École Polytechnique Universitaire (EPU, ingénieurs en Génie Biologique) et à l'Université Scientifique et Technologique de Hanoï (USTH, Vietnam). Plus récemment, j’ai réalisé des vacations à l’université Paul Sabatier (2018-2019).
Mes enseignements sont principalement axés sur l’observation et la compréhension du monde végétal. Ils portent sur des notions allant du fonctionnement de la cellule jusqu’à celui de l’organisme. Ces enseignements abordent des thèmes associés à la physiologie, à la biochimie et aux biotechnologies végétales. Ces enseignements sont dispensés aussi bien sous forme de cours magistraux que de travaux pratiques et dirigés.
MEMBRE COMITE
-
Expert scientifique (Physiologie Végétale) dans le Projet Tempus HERBS (Higher Education Reform of Biological Science ; 2006-9).
-
Expert CIR (Crédit Impôt Recherche) et JEI (Jeune Entreprise Innovante) depuis 2014.
-
Membre du bureau du GDR NOX (https://www.gdr-nox.cnrs.fr/).
ACTIVITE EDITORIALE
Je suis éditeur associé à la revue Frontier in Plant Science (thématique Plant Symbiotic Interactions).
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
-
LIENS
-
SCIENCE ET SOCIETE
Science & Société
HOBBY
Hobbies
AUTRES AFFILIATION
Autres affiliations
Alexander Johansson
Doctorant
SMS
alexander.johansson@inrae.fr
FORMATION ET SUJETS DE RECHERCHE
Titulaire d’un Master en « ingénieries et biotechnologies végétales » de l'université d'Umeå (2021), j’ai effectué mon stage de recherche dans l’équipe d'Alizée Malnoë au Plant Science Centre (Umeå). Mon projet visait à étudier la fonction redox de SOQ1, une protéine cruciale pour la régulation d'un mécanisme de photoprotection chez Arabidopsis thaliana. J’ai ensuite travaillé sur l'embryogenèse somatique chez SweTree (entreprise de biotechnologies végétales ; Suède). En novembre 2022, j’ai rejoint l’équipe SMS pour démarrer une thèse dont le sujet vise à comprendre les interconnexions entre la signalisation symbiotique chez les légumineuses et la tolérance au stress abiotique (CASTLE). Cette thèse est co-financée par le département SPE de l’INRAE par la région Occitanie.
Agathe Nicolas
Ingénieure d'Etude (ANR)
SMS
agathe.nicolas@inrae.fr
FORMATION ET SUJETS DE RECHERCHE
Après une licence en génétique et biologie cellulaire à l’université Lyon 1, je me suis orientée en master de biologie végétale dans la même université. Durant mon master, j’ai effectué un stage de M1 au laboratoire de reproduction et développement des plantes (RDP) de Lyon dans l’équipe signalisation cellulaire et endomembranes et un stage de M2 à l’institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB) de Versailles dans l’équipe développement et qualité de la graine. J’ai été recruté dans l’équipe SMS en janvier 2023 pour travailler avec Guilhem Reyt dans le cadre du projet ENDOSYMB : « Coordination between the root endodermis and endosymbioses ».
Baptiste Sarrette
Doctorant
SMS
baptiste.sarrette@inrae.fr
FORMATION ET SUJETS DE RECHERCHE
Diplômé d'une licence d'Ecologie (BOPE) et d'un master de biologie végétale (ADAM) à l'université Paul Sabatier de Toulouse (France) en 2020, je suis arrivé dans l'équipe SMS lors d'un stage pendant lequel j'ai caractérisé un biosenseur des espèces actives de l'oxygène (ROS) in planta et fait des études phylogénétiques sur des gènes capables de les synthétiser, les RBOH.
Je suis en thèse dans cette même équipe depuis 2021. Mon projet de thèse est financé par le projet ANR Duality qui cherche à démêler les mécanismes moléculaires impliquant l'immunité et la symbiose rhizobienne chez les plantes légumineuses. Mon rôle est d'étudier spécifiquement les interacteurs du gène NFP lors des interactions biotiques via des études de génétique, de transcriptomique et de microscopie.
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Zélie Lesterps
Doctorante
SMS
zelie.lesterps@inrae.fr
FORMATION ET SUJETS DE RECHERCHE
Après avoir obtenu ma licence de Biologie cellulaire et physiologie et mon master de biologie végétale ADAM (Adaptations, développement, amélioration des plantes, en association avec des microorganismes) à l'université Paul-Sabatier de Toulouse, j’ai commencé ma thèse en 2022. Mon projet de thèse est dans la continuité de mon stage de deuxième année de master. Il vise à étudier le gène AUX/IAA7 lors du développement racinaire ainsi que dans le cadre des endosymbioses racinaires, nodulation et mycorhization chez Medicago truncatula. Une autre partie de mon projet consiste à comparer les spécificités de ce gène de Medicago truncatula par rapport à son homologue chez Arabidopsis thaliana.
Tel
Mots clés
Julie Cullimore
Directrice de recherche, INRAE
SMS
julie.cullimore@inrae.fr
SUJETS DE RECHERCHE
Après une carrière en Angleterre, j’ai été recrutée par INRA en 1991 pour diriger une équipe travaillant sur la perception et réponse de la légumineuse aux signaux symbiotiques.
En 2018, j’ai laissé la direction de l’équipe à autres membres, et actuellement je poursuis ma recherche sur la perception des facteurs Nod par les récepteurs «lysin-motif receptor-like kinases» (LysM-RLK) en utilisant des approches de biologie moléculaire, biochimie et génétique.
FORMATION
PhD (1981); University of East Anglia, UK
Tel
Mots clés
Fabienne Maillet
Ingénieure d'Etude
SMS
fabienne.maillet@inrae.fr
SUJETS DE RECHERCHE
Sujets de recherche
FORMATION
Financements récents
FINANCEMENTS RECENTS
Financements récents
COLLABORATIONS
Collaborations
ENSEIGNEMENT
Enseignements
MEMBRE COMITE
Membre comité
ACTIVITE EDITORIALE
Activités éditoriales
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Productions scientifiques
LIENS
Science & Société
SCIENCE ET SOCIETE
Science & Société
HOBBY
Hobbies
AUTRES AFFILIATION
Autres affiliations
Tel
Mots clés
Frédéric Debellé
Chargé de Recherche INRAE
SMS
frederic.debelle@inrae.fr
SUJETS DE RECHERCHE
Sujets de recherche
FORMATION
Financements récents
FINANCEMENTS RECENTS
Financements récents
COLLABORATIONS
Collaborations
ENSEIGNEMENT
Enseignements
MEMBRE COMITE
Membre comité
ACTIVITE EDITORIALE
Activités éditoriales
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Productions scientifiques
LIENS
Science & Société
SCIENCE ET SOCIETE
Science & Société
HOBBY
Hobbies
AUTRES AFFILIATION
Autres affiliations
Tel
Mots clés
Guilhem Reyt
Chargé de Recherche CNRS
SUJETS DE RECHERCHE
Au cours de ma thèse (2010-2013), j'ai caractérisé la fonction et la régulation d'une famille de protéines, les ferritines contrôlant l'homéostasie du fer chez les plantes et l'architecture racinaire. Après mon doctorat, j'ai voulu continuer à travailler sur la nutrition des plantes, en étudiant comment le développement racinaire contrôle l'acquisition des nutriments. Pour cela, j'ai rejoint le groupe du Prof. David E. Salt travaillant sur la formation des barrières racinaires et comment elles contribuent à l'acquisition des éléments minéraux du sol, de l'eau et de l'assemblage du microbiome. En 2021, j'ai été recruté par le CNRS pour travailler sur le rôle des barrières de l’endoderme dans les interactions plante-microbe. Je m'intéresse particulièrement aux rôles de l'endoderme dans la régulation des échanges de nutriments entre les tissus vasculaires et les structures endosymbiotiques formées lors de la symbiose rhizobienne et mycorhizienne à arbuscule.
FORMATION
2010-2013 : PhD Université de Montpellier, director : F. Gaymard, J-F. Briat
2013-2014 : ATER Université de Montpellier
2014-2016 : Post-doc dans le groupe de D. Salt, University of Aberdeen
2016-2021 : Post-doc dans le groupe de D. Salt, University of Nottingham
FINANCEMENTS RECENTS
Financements récents
COLLABORATIONS
Collaborations
Léo Bunel
Doctorant
SMS
leo.bunel@inrae.fr
FORMATION ET SUJET DE RECHERCHE
Je suis diplômé de l'Université de Caen (Normandie, France) avec un master en biologie et agrosciences. En 2022, j'ai étudié l'effet de biostimulants sur la fixation de l'azote, la photosynthèse et l'absorption du soufre chez le soja dans le cadre d'un stage au laboratoire EVA à Caen. En 2023, j'ai travaillé sur l'amélioration de la tolérance à la sécheresse du pois au travers de l'étude de son architecture racinaire pendant un stage au sein de l'équipe SEVE dans le laboratoire EBI à Poitiers (Nouvelle-Aquitaine, France). En octobre 2023, j'ai rejoint l'équipe SMS au LIPME pour commencer une thèse sur la coordination entre l'endoderme racinaire et les endosymbioses chez Medicago truncatula. Ce projet vise à comprendre comment la déposition des barrières racinaires est coordonnée avec les symbioses mycorhiziennes et rhizobiennes, et comment cela impacte la nutrition de la plante. Dans ce but, j'utilise des approches méthodologiques variées telles que la microscopie confocale, les analyses nutritionnelles et la transcriptomique, que je combine avec des techniques d'exploration des données.
Adresse
Tel
Mots clés
Adresse
Tel
Mots clés
Prénom Nom
Fonction
Equipe
SUJETS DE RECHERCHE
Sujets de recherche
FORMATION
Financements récents
FINANCEMENTS RECENTS
Financements récents
COLLABORATIONS
Collaborations
ENSEIGNEMENT
Enseignements
MEMBRE COMITE
Membre comité
ACTIVITE EDITORIALE
Activités éditoriales
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Productions scientifiques
LIENS
Science & Société
SCIENCE ET SOCIETE
Science & Société
HOBBY
Hobbies
AUTRES AFFILIATION
Autres affiliations
Adresse
Tel
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Prénom Nom
Fonction
Equipe
SUJETS DE RECHERCHE
Sujets de recherche
FORMATION
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FINANCEMENTS RECENTS
Financements récents
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Membre comité
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Activités éditoriales
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SCIENCE ET SOCIETE
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Autres affiliations