MEMBRES
MEMBRES
Adresse
Tel
+33 (0) 5 61 28 57 03
Mots clés
Blanchet Nicolas
Fonction
Assistant ingénieur
SUJETS DE RECHERCHE
Je suis responsable d’expérimentations dont l’objectif est l’étude des réponses du tournesol aux stress abiotiques en conditions contrôlées et sur la plateforme de phénotypage haut-débit HELIAPHEN1. Par ailleurs je suis responsable technique de cette plateforme depuis sa mise en service en 2013. Depuis peu je suis aussi en charge de POLLIPHEN, une flotte de caméras déployable dans divers environnements, utilisée entre autres pour mesurer l’attractivité des plantes vis-à-vis des pollinisateurs.
FORMATION
-
BTSA productions horticoles j’ai poursuivi mes études avec une
-
Licence professionnelle expertise agro-environnementale et conduite de projet
ENSEIGNEMENT
Je réalise régulièrement des accueils de groupes scolaire ou professionnels pour présenter la plateforme HELIAPHEN et les expérimentations qui y sont menées
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Chabert Stan
Fonction
Chercheur post-doctoral
SUJETS DE RECHERCHE
Le projet HelEx a pour objectif d’utiliser des espèces extrêmophiles d’Helianthus sauvages, pour développer de nouvelles variétés de tournesol plus tolérantes aux effets du changement climatique, incluant les hautes températures et la sécheresse, tout en maintenant la qualité de la production et les services pour la biodiversité.
Ma contribution dans ce projet est double :
-
Étudier les effets de la température et du stress hydrique sur la production de ressources pour les insectes floricoles : nombre de fleurons par capitule, quantité de nectar et de pollen produits par fleuron, morphologie des fleurons ;
-
Développer un modèle de comptage et d’identification automatique des insectes floricoles sur des images de capitules de tournesol prises le jour et la nuit.
Adresse
Mots clés
Apis mellifera, biologie florale, comportement de butinage, nectar, pollen, pollinisation entomophile des cultures, stress hydrique, température, tournesol
FORMATION
J’ai effectué ma thèse (2014-2018) à l’INRAE d’Avignon avec Bernard Vaissière sur l’évaluation des besoins en pollinisation du colza en production de semence hybride. J’ai également développé une méthode rapide pour évaluer la taille des colonies d’abeilles mellifères introduites pour polliniser les cultures. Le tout dans l’objectif d’ajuster l’offre en colonies introduites à la demande en pollinisation des cultures.
J’ai poursuivi ma carrière avec un 1er postdoctorat effectué dans l’équipe Pollen Network de Syngenta (2019-2020, Lombez). J’y ai étudié le nourrissage des colonies d’abeilles mellifères avec des pâtes protéinées pour faire diminuer le butinage du pollen des colonies et ainsi augmenter les rendements des productions de semences de tournesol. Cette méthode est applicable à toutes les cultures nectarifères où les anthères sont isolées des stigmates : productions de semences hybrides, avocatier, Amaryllidacées, Apiacées, Cucurbitacées… Ceci était basé sur mes travaux de Master (avec Bernard Vaissière, INRAE Avignon) au cours desquels on a pu montrer que supplémenter les colonies avec du pollen dans les rayons permettait d’augmenter l’activité pollinisatrice des colonies, sur l’exemple de la culture du melon (monoïque). Au cours de cette expérience, j’ai également étudié l’effet de la distance des colonies et de la densité d’abeilles sur le rendement du tournesol oléique.
J’ai ensuite effectué un 2ème postdoctorat à l’Université de Floride avec Rachel Mallinger (2021-2023) pour étudier les bénéfices de la pollinisation croisée pour la culture du blueberry. La pollinisation croisée a notamment pour effet d’augmenter la taille des fruits et le rendement de cette culture. Plus globalement, j’ai pu recenser une liste de 156 cultures zoophiles pour lesquelles la pollinisation croisée améliore la quantité et/ou la qualité des fruits et graines produites. J’ai également pu valoriser le concept des mélanges variétaux comme outil d’adaptation des cultures aux effets du changement climatique par la synergie s’opérant entre génotypes via les effets bénéfiques de la pollinisation croisée.
Deux constantes ont émaillé mon parcours : (i) l’étude de l’effet de la température sur la biologie florale, et (ii) la dynamique de la sécrétion du nectar floral. Ce sont deux expertises que je mets aujourd’hui à profit dans le cadre du projet HelEx pour mon 3ème postdoctorat (2024-…) dans l’équipe ASTR du LIPME avec Nicolas Langlade.
Parcours :
-
2018 – Doctorat en sciences agronomiques, Université d’Avignon
« Pollinisation intégrée des cultures : intégrer les mécanismes liés à la température pour évaluer l’offre et la demande en pollinisation »
-
2012 – Master en écologie et biologie évolutive, Université Lyon 1
-
2010 – License de biologie, Université Lyon 1
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Liste de publications disponible sur ma page ResearchGate
Adresse
Tel
+33 (0)5 61 28 57 77
Mots clés
tournesol, phénotypage des plantes, interactions plantes-pollinisateurs, stress abiotique, génétique moléculaire, génomique
Creux Nicky
Fonction
Professeur Junior
SUJETS DE RECHERCHE
Mon équipe et moi nous concentrons sur la compréhension de la réponse florale du tournesol aux stress abiotiques et de leur impact sur les interactions entre le tournesol et ses pollinisateurs. Décrypter les bases génétiques qui sous-tendent l’attractivité du tournesol pour les pollinisateurs est essentiel pour renforcer son rôle dans le maintien de la diversité des pollinisateurs et des services écosystémiques qu’ils fournissent. Nous utilisons diverses méthodes pour explorer ce sujet, notamment le phénotypage des plantes, la sélection moléculaire et des modèles fondés sur l’intelligence artificielle (IA). L’objectif est d’aborder les questions de recherche à différentes échelles, du niveau moléculaire au niveau écophysiologique, afin d’obtenir une vision globale du système dans lequel nous travaillons. Ces recherches nous fournissent les outils nécessaires pour développer, à l’avenir, des tournesols favorables aux pollinisateurs et adaptés au climat.
FORMATION
Postdoctoral Fellow, University of California Davis, CA USA 2014-2018
Senior Lecturer, University of Pretoria, South Africa 2018 - 2025
ENSEIGNEMENT
BSc (Molecular Biology), University or Pretoria, South Africa 2002
BSc (Honours in Genetics), University of Pretoria, South Africa 2003
MSc (Genetics), University of of Pretoria, South Africa, 2007
PhD (Genetics) University of Pretoria, South Africa 2014
ACTIVITE EDITORIALE
Language Editor for Helia (https://heliajournal.org/en/sayfa/editorial-board-2353)
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
-
Mangani, R., Mazarura, J., Matlou, S., Marquart, A., Archer, E. and CREUX, N., 2025. The impact of past and current district-level climatic shifts on maize production and the implications for South African farmers. Theoretical and Applied Climatology, 156(2), p.109.
-
D’Angelo D, Sorrentino R, Nkomo T, Zhou X, Vaghefi N, Sonnekus B, Bose T, Cerrato D, Cozzolino L, CREUX, N. and D’Agostino, N., 2025. IMA GENOME-F20 A draft genome assembly of Agroatheliarolfsii, Ceratobasidiumpapillatum, Pyrenopezizabrassicae, Neopestalotiopsismacadamiae, Sphaerellopsisfilum and genomic resources for Colletotrichumspaethianum and Colletotrichumfructicola. IMA fungus, 16, p.e141732.
-
Mapfumo P, Archer E, Swanevelder DZ, Wilken M, CREUX NM and Read D., 2025. Genomic Characterisation of Bidens mottle virus in South Africa and an Assessment of the Impact on Helianthus annuus (Sunflower) in an Open Field Setting. Plant Pathology 74: 1266-1276
-
Mapfumo P, Buthelezi S, Wilkens M, Swanevelder D, Archer E and CREUX NM. 2024 Planting date and environmental effects on Sclerotinia head rot progression on sunflower. Plant Pathology 73 (5), 1112-1126
-
Mangani R, Gunn KM and CREUX NM, 2023. Projecting the effect of climate change on planting date and cultivar choice for South African dryland maize production. Agricultural and Forest Meteorology, 341, p.109695.
-
Catrice O, Holalu S, Terzić S, Todesco M, CREUX NM, Langlade NB. 2023 Progresses of the international community to understand sunflower–pollinator interactions through multiscale approaches. OCL 30 17, DOI: 10.1051/ocl/2023012
-
Marshall CM, Thompson VL, CREUX NM, Harmer SL. 2023. The circadian clock controls temporal and spatial patterns of floral development in sunflower. eLife, 12, p.e80984. 2
-
CREUX NM, Brown EA, Garner AG, Saeed S, Scher CL, Holalu SV, Yang D, Maloof JN, Blackman BK, Harmer SL. 2021. Flower orientation influences floral temperature, pollinator visits and plant fitness. New Phytologist 232: 868-879.
-
Atamian HS, CREUX NM, Brown EA, Garner AG, Blackman BK, Harmer SL. 2016. Circadian regulation of sunflower heliotropism, floral orientation, and pollinator visits. Science 353: 587- 590.
-
Spokevicius AV, Taylor L, Melder E, Van Beveran K, Tibbits J, CREUX NM, Bossinger G. 2016. The use of Induced Somatic Sector Analysis (ISSA) for studying genes and promoters involved in wood formation and secondary stem development. JoVE 116 doi: 10.3791/54553.
-
Hussey SG, Mizrachi E, CREUX NM, Myburg AA. 2013. Navigating the transcriptional roadmap regulating secondary cell wall deposition in plants. Frontiers in plant science 4:325.
-
CREUX NM, De Castro MH, Ranik M, Maleka MF, Myburg AA. 2013. Diversity and cis-element architecture of the promoter regions of cellulose synthase genes in Eucalyptus. Tree Genetics and Genomes 9: 989-1004.
-
CREUX NM, Bossinger G, Myburg AA, Spokevicius AV. 2013. Induced somatic sector analysis of cellulose synthase (CesA) promoter regions in woody stem tissues. Planta 237: 799 – 812.
-
CREUX NM, Ranik M, Berger DK, Myburg AA. 2008. Comparative analysis of orthologous cellulose synthase promoters from Arabidopsis, Populus and Eucalyptus: evidence of conserved regulatory elements in angiosperms. New Phytologist 179: 722 - 737.
-
Ranik M, CREUX NM, Myburg AA. 2006. Within-tree transcriptome profiling in wood-forming tissues of a fast growing Eucalyptus tree. Tree Physiology 26: 365 - 375.
LIEN
Adresse
Tel
+33 (0) 5 61 28 57 03
Mots clés
Genomic, Ecosystem Service, Pollinator, Sequencing
Donnadieu Cecile
Fonction
Génomicienne des services écosystémiques
SUJETS DE RECHERCHE
Je mène des projets de génomique fonctionnelle pour comprendre les bases génétiques des services écosystémiques du Tournesol. Ces projets ont pour objectif de maintenir et d'améliorer le service de production de ressources (nectar et pollen) et de promouvoir des systèmes agricoles favorables à la Biodiversité.
FORMATION
Biologiste de formation, experte en outils de Génomique, et de séquençage, j’ai passé 24 années à la direction de la plateforme de séquençage GeT-PlaGe.
FINANCEMENTS RECENTS
Dans le cadre de mes précédentes fonctions, j’ai porté sur la période 2019-2023 le projet SeqOccIn (https://get.genotoul.fr/seqoccin/). Ce projet visait à développer des nouvelles méthodes génomiques et bio-informatiques pour l’analyse des variations structurales, analyse des marques épigénétique et la métagénomique. Il réunissait une 30aine de partenaires publics et privés des domaines animaux et végétaux pour un montant global de 6M€.
Plusieurs projets sont en cours de dépôt : PréHelliABLEL
COLLABORATIONS
J’ai collaboré avec de nombreux laboratoires au fils des ans. J’ai aussi apporté mon aide au CHU de Toulouse dans le cadre du suivi des mutants SARS-Cov2 en Occitanie. Aujourd’hui, Vous étudierez le contrôle génétique du service éco-systémique en lien avec les entomologistes et les écologues du Julius Kuhne Institut JKI (DE) de l'université de Carinthie (AU). Vous contribuerez au développement d'outils méthodologiques comme le phénotypage haut-débit pour la caractérisation du comportement des pollinisateurs dans le cadre de PHENOME et en collaboration avec UC Berkeley, l'Indian Institute of Technology ROPAR, et JKI.
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Dans le cadre du projet HelEx : organisation des essais au champ, coordination des échanges de matériel biologique entre partenaires, et analyse des données en vue du développement d’un tournesol plus résistant aux conditions abiotiques extrêmes, avec une qualité de graine et une attractivité pour les pollinisateurs améliorées.
Participation à la rédaction de procédure qualité dans le cadre de la labélisation ISO 9001 du CRB Helia-Soja.
Adresse
Mots clés
tournesol, rendement, attractivité des pollinisateurs, expérimentations
Gani Marianne
Fonction
Ingénieure en expérimentation
SUJETS DE RECHERCHE
FORMATION
Master Gestion Intégrée du Littoral et Valorisation Halieutique (Université de Corse)
FINANCEMENTS RECENTS
Projet HelEx (Use of extremophile Helianthus species to mitigate climate change impact on feedstock and ecosystem services provided by sunflower).
LIENS
Metzdorf Marie-Sophie
Fonction
Main d'oeuvre occasionnelle
FORMATION
Master en Biologie Végétale Parcours Biologie des Plantes et Microorganismes Associés
Adresse
Jacquemot Marie-Pierre
Fonction
Assistante ingénieure en analyses biologiques
SUJETS DE RECHERCHE
FORMATION
Adresse:
FINANCEMENTS RECENTS
COLLABORATIONS
ENSEIGNEMENT
MEMBRE COMITE
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
LIENS
Langlade Nicolas
Fonction
Chef d'équipe ASTR
Directeur de recherche 2
SUJETS DE RECHERCHE
Je mène mes recherches pluridisciplinaires en étroite collaboration avec des partenaires privés (comme des entreprises de sélection), l’institut technique Terres Inovia et différents laboratoires académiques couvrant l’agronomie, la biologie des systèmes et l’évolution.
Mon objectif est de comprendre le contrôle génétique et moléculaire de la réponse du tournesol à son environnement abiotique et de fournir des connaissances pour l’adaptation du tournesol aux agrosystèmes agroécologiques.
Cela inclut :
-
Identifier les régions génomiques et les polymorphismes contrôlant la plasticité du rendement face au stress hydrique ou au froid. Pour cela, je collabore avec des agronomes (P. Casadebaig et Ph. Debaeke de l’UMR INRAE AGIR) pour modéliser le fonctionnement de la culture et caractériser les scénarios de stress. En utilisant la génétique quantitative, nous prédisons la plasticité et identifions des QTL ou clonons les gènes impliqués dans la tolérance du rendement.
-
Caractériser la réponse moléculaire du tournesol au stress hydrique à différents niveaux omiques : inférer des réseaux de régulation génique, intégrer des données de protéomique, métabolomique, transcriptomique et physiologie dans une approche de biologie des systèmes.
-
Définir l’idéotype de tournesol adapté aux nouveaux scénarios de stress abiotiques induits par la transition agroécologique (cultures associées, relay-cropping) aux niveaux phénotypique, moléculaire et génétique.
-
Étudier l’impact du changement climatique sur l’attractivité du tournesol pour les pollinisateurs et son contrôle moléculaire et génétique.
Après un engagement marqué dans la génomique du tournesol, je considère que la prochaine frontière est la phénomique. Je participe activement à l’infrastructure de phénotypage haut débit PhenoToul [1], qui regroupe depuis 2019 les plateformes TPMP (conditions contrôlées), Heliaphen (conditions semi-contrôlées) et Agrophen (en champ).
Par ailleurs, je m’implique fortement dans l’animation de la communauté française de recherche sur le tournesol :
-
Coordination du projet SUNRISE (Investissements d’Avenir),
-
Animation de la commission technique tournesol de Promosol,
-
Participation aux activités du CTPS (section Tournesol-Soja et VATE).
À l’international, je siège au conseil de l’International Sunflower Association (ISA) et au comité scientifique de l’ICSG (International Consortium for Sunflower Genomics).
FORMATION
J’ai commencé ma carrière en Suisse (doctorat à l’Université de Neuchâtel, 1998-2002) avec Enrico Martinoia, sur l’étude physiologique et moléculaire de l’exsudation d’acides organiques et du développement des racines en grappes chez le lupin.
J’ai ensuite travaillé au Royaume-Uni (John Innes Center, Norwich, 2002-2006), avec Enrico Coen, en me concentrant sur l’évolution du développement des feuilles et de la couleur des fleurs chez Antirrhinum (muflier).
Recruté en 2006 à l’INRA comme chercheur post-doctorant au Laboratoire de Reproduction et Développement des Plantes (École Normale Supérieure de Lyon), auprès de Peter Rogowsky, j’ai brièvement travaillé sur le développement des grains de maïs.
J’ai rejoint le LIPME (INRAE Occitanie Toulouse) en tant que chercheur sénior en 2007, et je suis directeur de recherche depuis 2016. Je dirige l’équipe ASTR (Abiotic Stress Tolerance in sunfloweR), qui vise à identifier les bases génétiques et moléculaires de l’adaptation du tournesol aux contraintes abiotiques (sécheresse et froid), aux niveaux physiologique et évolutif.
J’ai obtenu mon Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) en 2015 à l’Université de Toulouse, sur l’intégration des contraintes environnementales et évolutives dans les réseaux de régulation des gènes.
FINANCEMENTS RECENTS
-
Projet Investissment d’Avenir Sunrise[1] , coordinateur, responsable des WP management, phénotypage, et génétique, 2012-2020
-
Projet bilateral INRAE Syngenta COPER, coordinateur, 2020-2025
-
Projet Promosol Heliopollen, coordinateur, 2021-2023
-
Projet Plant2Pro CIMS-ON, responsable WP Phénotypage, 2020-2023
-
Projet Investissement d’Avenir Phenome-Emphasis[2] , partenaire, 2012-2024
-
Projet CASDAR IPHARD, responsable de WP Phénotypage, 2019-2022
-
Projet Promosol et semenciers Heliawild, coordinateur, 2022-2025
-
Projet Promosol Heliasen, coordinateur, 2018-2020
-
Projet bilateral INRAE Terres Inovia EPhECTS, coordinateur, 2018-2020
-
Projet Promosol Heliadiv, partenaire, 2015-2018
-
Projet Promosol Heliadiv 2, partenaire 2018-2020
COLLABORATIONS
Mots clés
Tournesol, génétique, génomique, phénotypage, sécheresse, froid, chaud, hautes températures, Heliaphen, Polliphen, Phenotoul
At LIPME
-
CRB Tournesol (tous les projets)
-
Plateforme bioinformatique (SUNRISE, ICSG, COPER, Heliopollen)
-
Equipe Sunflower Pest Interaction (SUNRISE, ICSG, CIMS-ON)
At INRAE
-
AGIR (SUNRISE, CIMS-ON, IPHARD)
-
UE APC (CIMS-ON, IPHARD, PhASTER)
-
MIAT (SUNRISE)
-
BFP (SUNRISE)
-
GQE (SUNRISE)
-
CNRGV (SUNRISE, ICSG)
At national level
-
Sorbonne Université (SUNRISE)
-
Terres Inovia (SUNRISE, EPhECTS)
-
Syngenta (SUNRISE, ICSG, COPER)
-
Lidea, MAS, Soltis, RAGT, Innolea (SUNRISE, ICSG, Heliawild)
-
Corteva (ICSG, Heliawild)
-
KWS (ICSG)
At international level
-
INTA Castelar Buenos Aires AR (HeliaSen)
-
U. British Columbia Vancouver (ICSG)
-
U. Georgia Athens (ICSG)
ENSEIGNEMENT
Je présente mes travaux de recherche et les plateformes de phénotypage de l’Université de Toulouse dans le cadre du Master TULIP-Graduate School [1], ainsi qu’à l’Université de Cordoba (Argentine) au niveau Master [1]https://www.labex-tulip.fr/La-Graduate-School/Le-Master-TULIP-GS
MEMBRE COMITE
Je participe à plusieurs instances :
-
Membre du conseil d’administration de l’International Sunflower Association
-
Membre du comité scientifique du Consortium International pour la Génomique du Tournesol
-
Animateur du comité tournesol de Promosol
-
Membre des comités scientifiques de Promosol et de la FSRSO
-
Membre de la section CTPS « Tournesol, soja et ricin » et de la commission VATE tournesol
-
Membre du comité des utilisateurs de l’UE Agroécologie et Phénotypage des Cultures
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Productions scientifiques sur le tournesol
Production scientifique lors de mes positions précédentes
Costa, M.M.R., Yang, S., Critchley, J., Feng, X., Wilson, Y., Langlade, N., Copsey, L., Hudson, A., 2012. The genetic basis for natural variation in heteroblasty in Antirrhinum. New Phytologist 196, 1251–1259.
Dubois, A., Raymond, O., Maene, M., Baudino, S., Langlade, N.B., Boltz, V., Vergne, P., Bendahmane, M., 2010. Tinkering with the C-function: a molecular frame for the selection of double flowers in cultivated roses. PLoS ONE 5, e9288.
Bensmihen, S., Hanna, A.I., Langlade, N.B., Micol, J.L., Bangham, A., Coen, E.S., 2008. Mutational spaces for leaf shape and size. HFSP journal 2, 110–120.
Whibley, A.C*., Langlade, N.B.*, Andalo, C., Hanna, A.I., Bangham, A., Thébaud, C., Coen, E., 2006. Evolutionary paths underlying flower color variation in Antirrhinum. Science 313, 963–966. *co-first authors
Weisskopf, L., Tomasi, N., Santelia, D., Martinoia, E., Langlade, N.B., Tabacchi, R., Abou- Mansour, E., 2006. Isoflavonoid exudation from white lupin roots is influenced by phosphate supply, root type and cluster-root stage. New Phytologist 171, 657–668.
Dreyer, C., Langlade, N., Hoffmann, M., Tripathi, N., Russell, S., Weigel, D., 2006. Inheritance And Natural Variation Of Adult Male Ornaments Of The Guppy: Pp010p. Reticulata: Pp010. Pigment Cell Research 19, 519.
Langlade, N.B., Feng, X., Dransfield, T., Copsey, L., Hanna, A.I., Thébaud, C., Bangham, A., Hudson, A., Coen, E., 2005. Evolution through genetically controlled allometry space. Proceedings of the National Academy of Sciences of the united states of america 102, 10221–10226.
Kania, A.*, Langlade, N.*, Martinoia, E., Neumann, G., 2003. Phosphorus deficiency- induced modifications in citrate catabolism and in cytosolic pH as related to citrate exudation in cluster roots of white lupin. Plant and soil 248, 117–127. *co-first authors
Langlade, N., Messerli, G., Weisskopf, L., Plaza, S., Tomasi, N., Smutny, J., Neumann, G., Martinoia, E., Massonneau, A., 2002. ATP citrate lyase: cloning, heterologous expression and possible implication in root organic acid metabolism and excretion. Plant, Cell & Environment 25, 1561–1569.
Massonneau, A., Langlade, N., Léon, S., Smutny, J., Vogt, E., Neumann, G., Martinoia, E., 2001. Metabolic changes associated with cluster root development in white lupin (Lupinus albus L.): relationship between organic acid excretion, sucrose metabolism and energy status. Planta 213, 534–542.
Neumann, G., Massonneau, A., Langlade, N., Dinkelaker, B., Hengeler, C., Römheld, V., Martinoia, E., 2000. Physiological Aspects of Cluster Root Function and Development in Phosphorus-deficient White Lupin ( Lupinus albus L.). Annals of Botany 85, 909–919. https://doi.org/10.1006/anbo.2000.1135
LIENS
Adresse
Tel
05 61 28 57 03
Mots clés
tournesol, génomique, génétique, stress abiotiques, sécheresse, froid, sénescence, protéine, transcriptome, métabolome
Moroldo Marco
Fonction
Ingénieur de recherche
SUJETS DE RECHERCHE
Je participe à la plupart des projets de l’équipe en fournissant mon expérience au niveau de l’analyse de données omiques, ce qui m’amène à travailler sur des problématiques biologiques très différentes comme la réponse au stress hydrique et thermique ou encore la caractérisation de tissus particuliers comme par exemple le nectaire ou l’anthère.
Ensuite, je développe à présent des activités de recherche centrées autour des déterminants génétiques de la qualité de la protéine et de l’attitude à la décorticabilité des graines en collaboration avec des entreprises de sélection et l’institut technique Terres Inovia.
FORMATION
J’ai fait une thèse (2002 – 2006) dans le laboratoire de Michele Morgante de l’université de Udine (Italie), en réalisant la première carte physique du génome nucléaire de la vigne et en effectuant le séquençage et l’annotation du génome chloroplastique de la vigne.
J’ai ensuite rejoint l’équipe d’Anne Françoise Adam-Blondon (INRAE Evry) en tant que post-doc (2006 – 2008), en travaillant sur la cartographie génétique et physique et sur les patrons de diversité nucléotidique d’un jeu gènes de résistance dans le génome nucléaire de la vigne.
J’ai été recruté à l’INRAE en 2010 en tant que responsable de la plateforme de génomique « CRB – GADIE » de l’unité GABI (INRAE Jouy en Josas), qui fournissait des prestations dans les secteurs du séquençage NGS, des microarrays et du stockage d’échantillons biologiques. J’ai travaillé sur cette plateforme pendant sept ans et, à la suite, j’ai intégré l’équipe de bioinformatique et biostatistique de la même unité GABI pendant quatre ans.
Finalement, j’ai rejoint l’équipe ASTR en 2021 en tant qu’analyste de données. J’ai commencé à travailler dès le début sur plusieurs projets impliquant des analyses de génétique d’association, de transcriptome et de métabolome. En parallèle, j’ai entamé le développement de mes propres activités de recherche, en rédigeant un premier projet sur l’interaction entre sénescence foliaire, stress hydrique et cultures intercalaires et un deuxième projet sur le contrôle génétique de la qualité de la protéine.
FINANCEMENTS RECENTS
-
Projet Plant2Pro « TOURT’OP », coordinateur, 2026-2027
-
Projet département BAP « CIMS-ON+ », coordinateur, 2022
COLLABORATIONS
-
Au LIPME :
-
Plateforme bioinformatique (CIMS-ON+, TOURT’OP)
-
A l’INRAE :
-
Unité MIA de Paris (CIMS-ON+)
-
Unité GABI de Paris (CIMS-ON+)
-
Plateforme Metabohub de Toulouse (CIMS-ON+)
-
Plateforme POPS de Paris (CIMS-ON+)
-
-
Au niveau national :
-
Université d’Aix-Marseille (CIMS-ON+, Helex)
-
CNRS de Paris (CIMS-ON+)
-
Terres Inovia (TOURT’OP)
-
Geves (TOURT’OP)
-
-
Au niveau international :
-
University of British Columbia Vancouver, Canada (Helex)
-
IGA Tech, Italie (CIMS-ON+, COPER, Helex)
-
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Production scientifique sur le tournesol :
-
Leconte J.M.L., Moroldo M., Blanchet N., Bindea G., Carrère S., Catrice O., Comar A., Labadie M., Marandel R., Pouilly N., Tapy C., Paris C., Mirleau-Thébaud V., Langlade N.B. (2025) Multi-scale characterisation of cold response reveals immediate and long-term impacts on cell physiology up to seed composition in sunflower. Plant Cell Environ. Apr;48(4):2596-2614
-
Moroldo M., Blanchet N., Duruflé H., Bernillon S., Berton T., Fernandez O., Gibon Y., Moing A., Langlade N.B. (2024) Genetic control of abiotic stress-related specialized metabolites in sunflower. BMC Genomics. Feb 20;25(1):199
Production scientifique précédente sur la période 2020 – 2023 :
-
Chaussé A.M., Roche S.M., Moroldo M., Hennequet-Antier C., Holbert S., Kempf F., Barilleau E., Trotereau J., Velge P. (2023) Epithelial cell invasion by Salmonella typhimurium induces modulation of genes controlled by aryl hydrocarbon receptor signaling and involved in extracellular matrix biogenesis. Virulence. Dec;14(1)
-
Adel-Patient K., Campeotto F., Grauso M., Guillon B., Moroldo M., Venot E., Dietrich C., Machavoine F., Castelli F.A., Fenaille F., Molina T.J., Barbet P., Delacourt C., Leite-de-Moraes M., Lezmi G. (2023) Assessment of local and systemic signature of eosinophilic esophagitis (EoE) in children through multi-omics approaches. Front Immunol. Mar 15;14
-
Rau A., Passet B., Castille J., Daniel-Carlier N., Asset A., Lecardonnel J., Moroldo M., Jaffrézic F., Laloë D., Moazami-Goudarzi K., Vilotte J.L. (2022) Potential genetic robustness of Prnp and Sprn double knockout mouse embryos towards ShRNA-lentiviral inoculation. Vet Res. Jul 7;53(1):54
-
Mach N., Moroldo M., Rau A., Lecardonnel J., Le Moyec L., Robert C., Barrey E. (2021) Understanding the holobiont: crosstalk between gut microbiota and mitochondria during long exercise in horse. Frontiers in Molecular Biosciences, Apr 8;8: 656204.
-
Lallias D., Bernard M., Ciobotaru C., Dechamp N., Labbé L., Goardon L., Le Calvez J.M., Bideau M., Fricot A., Prézelin A., Charles M., Moroldo M., Cousin X., Bouchez O., Roulet A., Quillet E., Dupont-Nivet M. (2021) Sources of variation of DNA methylation in rainbow trout: combined effects of temperature and genetic background. Epigenetics, Sep 16(9): 1031-1052.
-
Crisci E., Moroldo M., Vu Manh T.P., Mohammad A., Jourdren L., Urien C., Bouguyon E., Bordet E., Bevilacqua C., Bourge M., Pezant J., Pléau A., Boulesteix O., Schwartz I., Bertho N., Giuffra E. (2020) Distinctive cellular and metabolic reprogramming in porcine lung Mononuclear phagocytes infected with type 1 PRRSV strains. Frontiers in Immunology, Dec 7;11
-
Moroldo M., Munyaka P.M., Lecardonnel J., Lemonnier G., Venturi E., Chevaleyre C., Oswald I.P., Estellé J., Rogel-Gaillard C. Integrative analysis of blood and gut microbiota data suggests a non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD)-related disorder in French SLAdd minipigs (2020) Scientific Reports, Jan 14;10(1):234.
LIENS
ORCID : https://orcid.org/0000-0002-4440-4950
Linkedin : https://www.linkedin.com/in/marcomoroldo/
Pouilly Nicolas
Fonction
Ingénieur d'études
SUJETS DE RECHERCHE
Tolérance aux stress abiotiques, Interactions Tournesols-Pollinisateurs-Environnement
FORMATION
Maîtrise de Biochimie, Université de Pau et des Pays de l’Adour
COLLABORATIONS
Adresse
Tel
+33 (0) 5 61 28 53 25
Mots clés
Biologie moléculaire, génétique, génomique
Hélène Badouin, Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (Université Lyon1/CNRS)
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
-
Calderón-González, Á., Pérez Vich, B., Pouilly, N., Boniface, M. C., Louarn, J., Velasco, L., & Munos, S. (2023). Association Mapping for Broomrape Resistance in Sunflower. Frontiers in Plant Science, 13, 5423.
-
Badouin, H., Boniface, M.C., Pouilly, N., Fuchs, A.L., Vear, F., Langlade, N.B., Gouzy, J., & Munos, S. (2021). Pooled Single-Molecule transcriptomics identifies a giant gene under balancing selection in sunflower. BioRxiv. DOI:10.1101/2021.03.17.435796
-
Calderón-González, Á., Pouilly, N., Muños, S., Grand, X., Coque, M., Velasco, L., & Pérez-Vich, B. (2019). A SSR-SNP linkage map of the parasitic weed Orobanche cumana Wallr. including a gene for plant pigmentation. Frontiers in Plant Science, 10, 797.
-
Bonnafous, F., Fievet, G., Blanchet, N., Boniface, M.C., Carrère, S., Gouzy, J., Legrand, L., Marage, G., Bret-Mestries, E., Munos, S., Pouilly, N., Vincourt, P., Langlade, N.B., & Mangin, B. (2018). Comparison of GWAS models to identify non-additive genetic control of flowering time in sunflower hybrids. Theoretical and Applied Genetics, 131(2), 319-332.
-
Bordat, A., Marchand, G., Langlade, N.B., Pouilly, N., Muños, S., Dechamp-Guillaume, G., Vincourt, P., & Bret-Mestries, E. (2017). Different genetic architectures underlie crop responses to the same pathogen: the Helianthus annuus–Phoma macdonaldii interaction case for black stem disease and premature ripening. BMC Plant Biology, 17(1), 167.
-
Mangin, B., Bonnafous, F., Blanchet, N., Boniface, M.C., Bret-Mestries, E., Carrère, S., Cottret, L., Legrand, L., Marage, G., Pegot-Espagnet, P., Munos, S., Pouilly, N., Vear, F., Vincourt, P., & Langlade, N.B. (2017). Genomic Prediction of Sunflower Hybrids Oil Content. Frontiers in Plant Science, 8, 1633.
-
Mangin, B., Casadebaig, P., Cadic, E., Blanchet, N., Boniface, M.C., Carrère, S., Gouzy, J., Legrand, L., Mayjonade, B., Pouilly, N., André, T., Coque, M., Piquemal, J., Laporte, M., Vincourt, P., Muños, S., & Langlade, N.B. (2017). Genetic control of plasticity of oil yield for combined abiotic stresses using a joint approach of crop modelling and genome-wide association. Plant, Cell and Environment, 40(10), 2276-2291.
-
Badouin, H., Gouzy, J., Grassa, C.J., Murat, F., Staton, S.E., Cottret, L., Lelandais-Brière, C., Owens, G., Carrère, S., Mayjonade, B., et al. (2017). The sunflower genome illuminates the evolutionary history of the Asterids and provides new insights into oil metabolism and flowering time. Nature, 546, 148–152.
-
Mangin, B., Pouilly, N., Boniface, M.C., Langlade, N.B., Vincourt, P., Vear, F., & Muños, S. (2017). Molecular diversity of sunflower populations maintained as genetic resources is affected by multiplication processes and breeding for major traits. Theoretical and Applied Genetics, 130(6), 1099-1112.
-
Mayjonade, B., Gouzy, J., Donnadieu, C., Pouilly, N., Marande, W., Callot, C., Langlade, N.B., & Muños, S. (2016). Extraction of high-molecular-weight genomic DNA for the long-read sequencing of single molecules. BioTechniques, 61, 203–205.
-
Louarn, J., Boniface, M.C., Pouilly, N., Velasco, L., Pérez-Vich, B., Vincourt, P., & Muños, S. (2016). Sunflower Resistance to Broomrape (Orobanche cumana) Is Controlled by Specific QTLs for Different Parasitism Stages. Frontiers in Plant Science, 7, 590.
-
Gascuel, Q., Bordat, A., Sallet, E., Pouilly, N., Carrère, S., Roux, F., Vincourt, P., & Godiard, L. (2016). Effector Polymorphisms of the Sunflower Downy Mildew Pathogen Plasmopara halstedii and Their Use to Identify Pathotypes from Field Isolates. PLoS ONE, 11(2), e0148513.
-
Cadic, E., Coque, M., Vear, F., Grezes-Besset, B., Pauquet, J., Piquemal, J., Lippi, Y., Blanchard, P., Romestant, M., Pouilly, N., Rengel, D., Gouzy, J., Langlade, N.B., Mangin, B., & Vincourt, P. (2013). Combined linkage and association mapping of flowering time in Sunflower (Helianthus annuus L.). Theoretical and Applied Genetics, 126, 1337-1356.
-
Vincourt, P., As-Sadi, F., Bordat, A., Langlade, N.B., Gouzy, J., Pouilly, N., Lippi, Y., Serre, F., Godiard, L., Tourvieille de Labrouhe, D., & Vear, F. (2012). Consensus mapping of major resistance genes and independent QTL for quantitative resistance to sunflower downy mildew. Theoretical and Applied Genetics, 125, 909-920.
-
Merah, O., Langlade, N.B., Alignan, M., Roche, J., Pouilly, N., Lippi, Y., Vear, F., Cerny, M., Bouniols, A., Mouloungui, Z., & Vincourt, P. (2012). Genetic analysis of phytosterol content in sunflower seeds. Theoretical and Applied Genetics, 125, 1589-1601.
-
Delourme, R., Piel, N., Horvais, R., Pouilly, N., Domin, C., Vallée, P., Falentin, C., Manzanares-Dauleux, M., & Renard, M. (2008). Molecular and phenotypic characterization of near isogenic lines at QTL for quantitative resistance to Leptosphaeria maculans in oilseed rape (Brassica napus L.). Theoretical and Applied Genetics, 117(7), 1055-1067.
-
Pouilly, N., Delourme, R., Alix, K., & Jenczewski, E. (2008). Repetitive sequence-derived markers tag centromeres and telomeres and provide insights into chromosome evolution in Brassica napus. Chromosome Research, 16(5), 683-700.
-
Prieto, J.L., Pouilly, N., Jenczewski, E., Deragon, J.M., & Chêvre, A.M. (2005). Development of crop-specific transposable element (SINE) markers for studying gene flow from oilseed rape to wild radish. Theoretical and Applied Genetics, 111(3), 446-455.
Adresse
Tueux Guillaume
Fonction
PhD student
SUJETS DE RECHERCHE
Contrôle génétique et moléculaire du microbiote de nectar de tournesol et son impact sur l’attractivité pour les pollinisateurs
FORMATION
Ecole d’ingénieurs de Purpan (2016-2021)
Coordinateur des projets d’innovation ainsi que du phénotypage pour la pollinisation du tournesol chez Syngenta (2022-2023)
Mots clés
FINANCEMENTS RECENTS
Projet Attracthol financement Carnot Plant2Pro
COLLABORATIONS
Collaboration avec Terres Inovia
LIENS