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Nicolas Langlade

Fonction

Chef d'équipe ASTR
Directeur de recherche 2

SUJETS DE RECHERCHE

I conduct my multi-disciplinary research in close collaboration with private partners such as breeding companies, technical institute Terres Inovia and different academic labs covering agronomy, systems biology, and evolution.

My aim is to understand the genetic and molecular control of sunflower response to its abiotic environment and to provide knowledge for the adaptation of sunflower to agroecological agrosystems.

This includes:

  • Identifying genomic regions and genetic polymorphisms controlling plasticity of yield for drought or cold stresses. For this, I collaborate with agronomists (P. Casadebaig and Ph. Debaeke from UMR INRAE AGIR) to model crop functioning and characterize stress scenarios. Using quantitative genetics, this allows us to predict plasticity and identify QTL or clone the genes involved in yield tolerance.

  • Identify the molecular response of sunflower to drought stress at different omics levels: infer gene regulatory network, integrate proteomics, metabolomics, transcriptomics and physiological data in a systems biology approach

  • Identify the sunflower ideotype adapted to novel abiotic stress scenarios induced by the agroecological transition (relay-cropping, inter-cropping) at the phenotypic, molecular and genetic levels

  • Identify the impact of climate change on sunflower pollinator attractivity and its molecular and genetic control

 

 

After a strong involvement in sunflower genomics, I believe the next frontier is sunflower phenomics. I participate actively to the high-throughput phenotyping infrastructure Phenotoul [1] which, since 2019, brings together the TPMP platforms under controlled conditions, Heliaphen under semi-controlled conditions and Agrophen in the field.

In addition, I am strongly committed to the animation of the French sunflower research community through the coordination of the SUNRISE Investment for the Future Project, the animation of the sunflower technical commission of Promosol, the participation in the activities of the variety registration institution CTPS (in the Sunflower-Soy section and in the VATE). Internationally, I participate to the board of the International Sunflower Association (ISA) and on the scientific committee of the ICSG (International Consortium for Sunflower Genomics).

 [1] www.inrae.fr/phenotoul

FORMATION

I started my career in Switzerland (PhD at the University of Neuchâtel, 1998-2002) with Enrico Martinoia on the physiological and molecular study of organic acid exudation and development of cluster roots in lupin.

Then I worked in the United-Kingdom (John Innes Center, Norwich, 2002-2006), with Enrico Coen, focusing on the evolutionary development of leaves and flower colour in Antirrhinum.

Recruited in 2006 at INRA as a post-doctorate researcher at the Plant Reproduction and Development Laboratory (Ecole Normale Supérieure de Lyon) with Peter Rogowsky, I briefly worked on the development of corn kernels.

I joined LIPME (INRAE Occitanie Toulouse) as senior researcher in 2007 and I am now research director since 2016. I lead the ASTR research team (Abiotic Stress Tolerance in sunfloweR) which aims at identifying the genetic and molecular bases of adaptation of sunflower to abiotic constraints (drought and cold) at physiological and evolutionary levels.

I obtained my Habilitation à Diriger les Recherches on the integration of environmental and evolutionary constraints in gene regulatory networks, in 2015 from the University of Toulouse.

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Mots clés

FINANCEMENTS RECENTS

  1. Projet Investissment d’Avenir Sunrise[1] , coordinateur, responsable des WP management, phénotypage, et génétique, 2012-2020

  2. Projet bilateral INRAE Syngenta COPER, coordinateur, 2020-2025

  3. Projet Promosol Heliopollen, coordinateur, 2021-2023

  4. Projet Plant2Pro CIMS-ON, responsable WP Phénotypage, 2020-2023

  5. Projet Investissement d’Avenir Phenome-Emphasis[2] , partenaire, 2012-2024

  6. Projet CASDAR IPHARD, responsable de WP Phénotypage, 2019-2022

  7. Projet Promosol et semenciers Heliawild, coordinateur, 2022-2025

  8. Projet Promosol Heliasen, coordinateur, 2018-2020

  9. Projet bilateral INRAE Terres Inovia EPhECTS, coordinateur, 2018-2020

  10. Projet Promosol Heliadiv, partenaire, 2015-2018

  11. Projet Promosol Heliadiv 2, partenaire 2018-2020

 [1]www.inrae.fr/sunrise

 [2]https://www.phenome-emphasis.fr/

COLLABORATIONS

At LIPME

  1. CRB Tournesol (tous les projets)

  2. Plateforme bioinformatique (SUNRISE, ICSG, COPER, Heliopollen)

  3. Equipe Sunflower Pest Interaction (SUNRISE, ICSG, CIMS-ON)

At INRAE

  1. AGIR (SUNRISE, CIMS-ON, IPHARD)

  2. UE APC (CIMS-ON, IPHARD, PhASTER)

  3. MIAT (SUNRISE)

  4. BFP (SUNRISE)

  5. GQE (SUNRISE)

  6. CNRGV (SUNRISE, ICSG)

At national level

  1. Sorbonne Université (SUNRISE)

  2. Terres Inovia (SUNRISE, EPhECTS)

  3. Syngenta (SUNRISE, ICSG, COPER)

  4. Lidea, MAS, Soltis, RAGT, Innolea (SUNRISE, ICSG, Heliawild)

  5. Corteva (ICSG, Heliawild)

  6. KWS (ICSG)

At international level

  1. INTA Castelar Buenos Aires AR (HeliaSen)

  2. U. British Columbia Vancouver (ICSG)

  3. U. Georgia Athens (ICSG)

ENSEIGNEMENT

I present my research and phenotyping platforms at the university of Toulouse at the Master TULIP-Graduate School [1] and at the University of Cordoba (Argentina) at the Master level.

 [1]https://www.labex-tulip.fr/La-Graduate-School/Le-Master-TULIP-GS

MEMBRE COMITE

I participate to several organizations :

  • Board member of the International Sunflower Association

  • Member of the scientific committee of the International Consortium for Sunflower Genomics

  • Animator of the Promosol sunflower committee

  • Member of the Promosol and FSRSO scientific committee

  • Member of the CTPS “Sunflower, soy and castorbean” section and sunflower VATE commission

  • Member of the UE Agroecologie et Phenotypage des Cultures user committee

ACTIVITE EDITORIALE

Activités éditoriales

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

Productions scientifiques

LIENS

HOBBY

Cooking, sculpting, sport

 
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Olivier Catrice

Fonction

Assistant ingénieur

SUJETS DE RECHERCHE

Tolérance aux stress abiotiques

Interactions Tournesols-Pollinisateurs-Environnement

FORMATION

Master Biologie Intégrative et Physiologie Végétales Paris 6

FINANCEMENTS RECENTS

HelioPollen : Financement 38 k€ par Promosol

COLLABORATIONS

Nicky Creux, Plant and Soil Sciences, Forestry & Agricultural Biotechnology Institute, Pretoria, République d’Afrique du Sud (2021)

MEMBRE COMITE

Membre du comité Développement Durable du LIPME

Représentant CGT au CHSCT du Centre Occitanie-Toulouse

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

HOBBY

Apiculture

Arboriculture

Musique et lutherie

Voile et construction navale

 
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Mots clés

Nicolas Pouilly

Fonction

Assistant ingénieur

SUJETS DE RECHERCHE

Tolérance aux stress abiotiques 

FORMATION

Maîtrise de Biochimie, Université de Pau et des Pays de l’Adour

COLLABORATIONS

Hélène Badouin, Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (Université Lyon1/CNRS)

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

- Calderón-González, Á., Pouilly, N., Muños, S., Grand, X., Coque, M., Velasco, L., & Pérez-Vich, B. (2019). A SSR-SNP linkage map of the parasitic weed Orobanche cumana Wallr. including a gene for plant pigmentation. Frontiers in Plant Science, 10, 797.

- Bonnafous, F., Fievet, G., Blanchet, N., Boniface, M.C., Carrère, S., Gouzy, J., Legrand, L., Marage, G., Bret-Mestries, E., Munos, S., Pouilly, N., Vincourt, P., Langlade, N.B., & Mangin, B. (2018). Comparison of GWAS models to identify non-additive genetic control of flowering time in sunflower hybrids. Theoretical and Applied Genetics, 131(2), 319-332.

- Bordat, A., Marchand, G., Langlade, N.B., Pouilly, N., Muños, S., Dechamp-Guillaume, G., Vincourt, P. & Bret-Mestries E. (2017). Different genetic architectures underlie crop responses to the same pathogen: the {Helianthus annuus* Phoma macdonaldii} interaction case for black stem disease and premature ripening. BMC plant biology, 17(1), 167.

- Mangin, B., Bonnafous, F., Blanchet, N., Boniface, M.C., Bret-Mestries, E, Carrère, S., Cottret, L., Legrand, L., Marage, G., Pegot-Espagnet, P., Munos, S., Pouilly, N., Vear, F., Vincourt, P., & Langlade, N.B. (2017). Genomic Prediction of Sunflower Hybrids Oil Content. Frontiers in plant science, 8, 1633.

- Mangin, B., Casadebaig, P., Cadic, E., Blanchet, N., Boniface, M.C., Carrère, S., Gouzy, J., Legrand, L., Mayjonade, B., Pouilly, N., André, T., Coque, M., Piquemal, J., Laporte, M., Vincourt, P., Muños, S., & Langlade, N.B. (2017). Genetic control of plasticity of oil yield for combined abiotic stresses using a joint approach of crop modelling and genome-wide association. Plant, Cell and Environment 40(10):2276-2291.

- Badouin, H., Gouzy, J., Grassa, CJ., Murat, F., Staton, SE., Cottret, L., Lelandais-Brière, C., Owens, G., Carrère, S., Mayjonade, B., et al. (2017). The sunflower genome illuminates the evolutionary history of the Asterids and provides new insights into oil metabolism and flowering time. Nature 546, 148–152.

- Mangin, B., Pouilly, N., Boniface, M.C., Langlade, N.B., Vincourt, P., Vear, F. & Muños, S. (2017). Molecular diversity of sunflower populations maintained as genetic resources is affected by multiplication processes and breeding for major traits. Theoretical and Applied Genetics 130(6):1099-1112.

- Mayjonade, B., Gouzy, J., Donnadieu, C., Pouilly, N., Marande, W., Callot, C., Langlade, NB., & Muños, S. (2016). Extraction of high-molecular-weight genomic DNA for the long-read sequencing of single molecules. BioTechniques 61: 203–205.

- Louarn, J., Boniface, M.C., Pouilly, N., Velasco, L., Pérez-Vich, B., Vincourt, P., & Muños, S. (2016). Sunflower Resistance to Broomrape (Orobanche cumana) Is Controlled by Specific QTLs for Different Parasitism Stages. Front Plant Sciences 7: 590.

- Gascuel, Q., Bordat, A., Sallet, E., Pouilly, N., Carrère, S., Roux, F., Vincourt, P., & Godiard, L. (2016). Effector Polymorphisms of the Sunflower Downy Mildew Pathogen Plasmopara halstedii and Their Use to Identify Pathotypes from Field Isolates. PloS one, 11(2), e0148513.

- Cadic, E., Coque, M., Vear, F., Grezes-Besset, B., Pauquet, J., Piquemal, J., Lippi Y., Blanchard, P., Romestant, M., Pouilly, N., Rengel, D., Gouzy, J., Langlade, N.B., Mangin, B., & Vincourt, P. (2013). Combined linkage and association mapping of flowering time in Sunflower (Helianthus annuus L.). Theoretical and Applied Genetics 126:1337-1356.

- Vincourt, P., As-Sadi, F., Bordat, A., Langlade, N.B., Gouzy, J., Pouilly, N., Lippi, Y., Serre, F., Godiard, L., Tourvieille de Labrouhe, D., & Vear, F. (2012). Consensus mapping of major resistance genes and independent QTL for quantitative resistance to sunflower downy mildew. Theoretical and Applied Genetics 125:909-920.

- Merah, O., Langlade, N.B., Alignan, M., Roche, J., Pouilly, N., Lippi, Y., Vear, F., Cerny, M., Bouniols, A., Mouloungui, Z., & Vincourt, P. (2012). Genetic analysis of phytosterol content in sunflower seeds. Theoretical and Applied Genetics 125:1589-1601.

- Delourme, R., Piel, N., Horvais, R., Pouilly, N., Domin, C., Vallée, P., Falentin, C., Manzanares-Dauleux, M., & Renard, M. (2008). Molecular and phenotypic characterization of near isogenic lines at QTL for quantitative resistance to Leptosphaeria maculans in oilseed rape (Brassica napus L.). Theoretical and Applied Genetics 117(7): 1055-1067.

- Pouilly, N., Delourme, R., Alix, K., & Jenczewski, E. (2008). Repetitive sequence-derived markers tag centromeres and telomeres and provide insights into chromosome evolution in Brassica napus. Chromosome Research 16(5): 683-700.

- Prieto, J.L., Pouilly, N., Jenczewski, E., Deragon, JM., & Chêvre, A.M. (2005). Development of crop-specific transposable element (SINE) markers for studying gene flow from oilseed rape to wild radish. Theoretical and Applied Genetics 111(3): 446-455.

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Marco Moroldo

Fonction

Ingénieur de recherche

SUJETS DE RECHERCHE

Analyse de données omiques, intégration de données, génétique d’association

FORMATION

Financements récents

FINANCEMENTS RECENTS

J’ai démarré ma carrière en Italie faisant un doctorat à l’université de Udine, dans l’équipe de Michele Morgante, ensuite je suis parti pour un post-doc en France à l’INRAE, en travaillant sur la cartographie physique et sur la diversité nucléotidique des gènes de résistance de la vigne.

 

J’ai été recruté à l’INRAE en 2010 en tant que responsable de la plate-forme de génomique @BRIDGe (département génétique animale), qui proposait plusieurs services dans le secteur de la génomique, notamment des analyses de transcriptome par puce et du reséquençage NGS par capture de séquence.

 

Ensuite, entre 2016 et 2020 j’ai travaillé en tant qu’analyste de données au sein de l’équipe PSGEN (département génétique animale). Dans ce contexte, je me suis occupé surtout de données de transcriptome et d’intégration entre données de transcriptome et d’autres données omiques.

 

J’ai rejoint l’équipe ASTR en 2021 pour m’occuper d’analyse de données omiques, de génétique d’association et pour développer à moyen terme ma propre thématique de recherche.

COLLABORATIONS

Collaborations

ENSEIGNEMENT

Enseignements

MEMBRE COMITE

Membre comité

ACTIVITE EDITORIALE

Activités éditoriales

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

LIENS

 
 
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Jean Leconte

Fonction

Etudiant en thèse (2021-2024)

SUJETS DE RECHERCHE

J'étudie la tolérance au froid du tournesol cultivé dans le cadre d'une pratique agriculturale nommée le semis précoce. Dans ce but j'effectue des activités de phénotypages de plantes cultivées en conditions contrôlées, sur la plateforme HELIPAHEN ou bien en champs. Mes activités se poursuivent au laboratoire où j'effectue du génotypages, des analyses d'expressions de gènes candidats, diverses colorations de tissues biologiques. Enfin une partie de mes activités consistes à analyser ces données grâce au logiciel R. 

FORMATION

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Licence de bioinformatique, Université de Paris (Anciennement Paris Diderot, Paris 7)

Licence en biologie des organismes, des populations et de l'environnement (Université Paul Sabatier)

Master Adaptation, Developpement et Amélioration des plantes en interaction avec des Microorganismes (Université Paul Sabatier)

FINANCEMENTS RECENTS

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Mots clés

Financement de thèse : CIFRE

 
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Mots clés

Blanchet Nicolas

Fonction

Technicien de recherche

SUJETS DE RECHERCHE

Je suis technicien en expérimentation et production végétale au LIPMe depuis 2011. Je participe à l’étude des réponses du tournesol aux stress froid et au stress hydrique en conditions contrôlées et sur la plateforme de phénotypage haut débit HELIAPHEN. Par ailleurs je suis responsable technique de cette plateforme.

FORMATION

BTS Productions Horticoles

Licence professionnelle Expertise agro-environnementale et conduite de projet

FINANCEMENTS RECENTS

Financements récents

COLLABORATIONS

Collaborations

ENSEIGNEMENT

Enseignements

MEMBRE COMITE

Membre comité

ACTIVITE EDITORIALE

Activités éditoriales

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

Productions scientifiques

LIENS

Science & Société

SCIENCE ET SOCIETE

Science & Société

HOBBY

Hobbies

AUTRES AFFILIATION

Autres affiliations

 
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Mots clés

Tapy Camille

Fonction

Technicienne de recherche

SUJETS DE RECHERCHE

Stress abiotiques

FORMATION

BTS Productions Horticoles

FINANCEMENTS RECENTS

Financements récents

COLLABORATIONS

CRB tournesol-équipe SPI- UE Auzeville-partenaires semenciers du réseau Hélianthus

ENSEIGNEMENT

Enseignements

MEMBRE COMITE

Comité locaux-correspondante handicap d’unité

ACTIVITE EDITORIALE

Activités éditoriales

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

Productions scientifiques

LIENS

Science & Société

SCIENCE ET SOCIETE

Science & Société

HOBBY

Hobbies

AUTRES AFFILIATION

Autres affiliations