Travailler au LIPME
Vous êtes attiré par le domaine de la recherche en biologie végétale, l’étude de la réponse des plantes à leur environnement, et plus particulièrement des interactions symbiotiques et pathogènes?
Vous pouvez postuler directement ci-dessous ou consultez régulièrement les offres de postes proposés par l'INRAE et le CNRS:
Thèse sur le risque d’émergence et de dissémination de nouveaux variants de Ralstonia solanacearum en France métropolitaine
Contexte
Parmi les bactéries pathogènes de végétaux classées organismes de quarantaine dans l’Union Européenne, le complexe d’espèces Ralstonia solanacearum est responsable de flétrissement bactérien létal sur plus de 250 espèces de plantes, incluant des espèces d’intérêt agronomique majeur et est présent sur tous les continents.
Environnement de travail, missions et activités
Les 15 premiers mois de la thèse, vous serez intégré(e) dans une équipe de recherche au Laboratoire de la Santé des Végétaux (LSV) (Anses, Angers) pour étudier la diversité génétique, le pouvoir pathogène et la survie de souches de Ralstonia pseudosolanacearum (Rp) isolées de rhizomes de curcuma interceptées à l’import en France métropolitaine.
Au LSV, votre mission sera de déterminer (1) les liens phylogénomiques entre les souches de R. pseudosolanacearum interceptées à l’import en France métropolitaine et celles isolées en Europe / hors Europe, (2) la gamme de plantes hôtes de ces souches et (3) les conditions environnementales qui permettent la survie de ces souches.
Les 21 derniers mois de la thèse, vous serez intégré(e) dans une équipe de recherche au Laboratoire des Interactions plantes-Microbes-Environnement (LIPME) (INRAE, Toulouse) dans l'équipe RAP, pour étudier la capacité d’échange de matériel génétique entre souches de R. solanacearum (Rs) et R. pseudosolanacearum.
Au LIPME, votre mission sera d'évaluer (1) la capacité des souches de Rs et Rp à échanger du matériel génétique dans différentes conditions environnementales, (2) la quantité et les fonctions des gènes qui peuvent être échangés et (3) les caractéristiques phénotypiques des nouveaux variants isolés après transfert horizontal de gènes (virulence, gamme d’hôte).
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▶️ Formation et compétences recherchées : Master microbiologie/génomique, ou diplômé d’une Ecole d’Ingénieur en Agronomie avec une équivalence pour une inscription en doctorat, avec un intérêt réel pour la thématique des bactéries phytopathogènes, de l’épidémiologie et de l’évolution. Des compétences de laboratoire en microbiologie, en biologie moléculaire, ainsi que des compétences en épidémiologie et en analyse de données génomiques voire bio-informatique sont fortement souhaitables.
▶️ Début du contrat : 01/10/2026
▶️ Rémunération : 2300€ brut
▶️ Adressez votre candidature ( CV et lettre de motivation) avant le 15/06/2026 à : Alice Guidot et Amandine Cunty
▶️ Plus d'infos : https://jobs.inrae.fr/ot-29113
Offre de stage de césure pour étudiant.e de formation agronomique / agroécologique, master ou école d’ingénieur en césure avant M2
▶️ Thème : Etude du rôle de "MYCONOD", un long ARN non-codant au cours de la symbiose rhizobienne
▶️Contexte : L’interaction symbiotique entre légumineuses ☘️ et bactéries rhizobiennes🦠 fixatrices d'azote aboutit à la formation d’un nouvel organe racinaire appelé nodosité, au sein duquel l'azote atmosphérique est fixé au bénéfice de la plante hôte et en échange de nutriments. La symbiose mycorhizienne à arbuscules (SMA) conduit quant à elle, à la formation d’arbuscules intracellulaires permettant d’intenses échanges nutritionnels entre le champignon et la plante. L'établissement de ces endosymbioses implique une large reprogrammation de l'expression des gènes de la plante hôte. Les longs ARNs non-codants, classe émergente de régulateurs moléculaires jouant un rôle notamment dans le contrôle de l'expression génique, ont été trouvés abondants dans le génome de Medicago truncatula et une grande partie d'entre eux sont régulés lors des symbioses. Cependant, leurs rôles lors de ces interactions sont encore peu étudiés. Un long ARN non codant, MYCONOD, a été identifié avec une expression spécifique dans les tissus symbiotiques à la fois lors de la symbiose et lors de la SMA, chez Medicago truncatula. La modulation du niveau de transcrits dans les racines montre que MYCONOD serait un régulateur négatif des deux endosymbioses.
▶️ Objectifs du stage :
Le sujet de stage s'inscrit au sein du projet de doctorat visant à comprendre le rôle de MYCONOD afin :
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D'identifier des lignées stables homozygotes de mutants pour MYCONOD chez Medicago truncatula par génotypage des descendances issues de plantes transgéniques.
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De caractériser le profil d'expression de MYCONOD tout au long de la formation des nodosités de Medicago truncatula en interaction avec Sinorhizobium meliloti.
▶️ Méthodes : fusion transcriptionnelle promoteur-GUS médiée par transformation via Agrobacterium rhizogenes des systèmes racinaires, suivi d'analyses microscopiques et cytologiques.
▶️ Profil recherché : Étudiant.e de formation agronomique / agroécologique, master ou école d’ingénieur en césure avant M2; attrait pour l'expérimentation en laboratoire, en biologie moléculaire et biologie végétale.
▶️ Conditions : Stage de césure conventionné de 3 à 4 mois dès Novembre 2026 avec gratification. Équipe ENOD du LIPME
▶️ Adressez votre candidature avec CV et lettre de motivation auprès de : Melissa Simonnet, Andreas Niebel et Matthias Benoit
Assistant-e Ingénieur-e en biologie moléculaire en CDD
📢 On recrute un Assistant-e Ingénieur-e en biologie moléculaire en CDD !
Vous intégrerez l'équipe ENOD (Endosymbiotic infection and nodule development) du LIPME sur le centre INRAE Occitanie-Toulouse.
L'équipe ENOD s'intéresse aux mécanismes cellulaires et moléculaires régissant la mise en place de la symbiose fixatrice d'azote entre plantes ☘️ et bactéries 🦠. Dans le cadre du projet ANR ISLAND, vous aurez pour mission d’apporter un soutien technique aux activités de recherche de l’équipe, en particulier dans le domaine de la biologie moléculaire.
▶️ Bac+2/3 en biologie moléculaire, biotechnologie
▶️ Contrat à partir du 01/09/2026 pour 1 an
▶️ Candidatez avant le 30/06/2026 : https://jobs.inrae.fr/ot-29052
🔗 Plus d'infos
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